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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002570`

染色体: Chr08 坐标: 25066917-25072508 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002570`
名称	SmilChr08G002570
描述	uncharacterized SmilChr08G002570
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25066917 - 25072508 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997208`
GeneID	`130997208`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997208`
原始查询	`LOC130997208`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818661]; symbol=AT2G40660; hit=AT2G40660; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818661]; symbol=AT2G40660; hit=AT2G40660; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G40660` (AT2G40660) Nucleic acid-binding, OB-fold-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818661] identity=59.2; qcov=0.912; evalue=1.09e-123; confidence=high
Rice	`Os01g0821800` - identity=52.3; qcov=0.971; evalue=5.5e-118; confidence=high
GO	GO:0000049 (tRNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF01588 (tRNA_bind); PF21972 (Arc1p_N_like)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997208

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778442.1`
2	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778442.1`
3	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057778442.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778442.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778442.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25067179`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B81,B88,B90,B92
`Chr8:25067577`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C39,C83
`Chr8:25067595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:25067685`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C39,C83
`Chr8:25070308`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B7,B80
`Chr8:25071218`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A5,B7,B80
`Chr8:25071219`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D3
`Chr8:25071742`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:25072289`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C23
`Chr8:25072294`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C39,C83

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778442.1

374 aa

187

374

Arc1p_N_like

tRNA_bind

PF21972 Arc1p_N_like 71-132 aa PF01588 tRNA_bind 219-313 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778442.1`	Pfam	`PF21972`	Arc1p_N_like	Domain	71	132	8.1e-13	49.2	Nuclear-export cofactor Arc1p
`XP_057778442.1`	Pfam	`PF01588`	tRNA_bind	Domain	219	313	3.6e-26	91.8	Putative tRNA binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922459.1
ATTCTTCTCTTATTTCATTGCAAGCCTGGAATAAACTGACACATGTATTTTTGGCATGTGGGCTAAAGTGGGCGATTCCGGTTAGCCCATTAAAAAGTAATGGGAAAATTCACGAATTCGAAAGAACCCTAGAAGAAACTACAGCGCTTCAATTTCATCAGCTGCCCTTGAGAATTCAATTTTCTGCAAGGAAACCAAGTTATGGCATCGCGAACAATGGACACTACAATGCGTGATATGTGTACTGTGATCTTTAAACT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997208
ATGGCATCGCGAACAATGGACACTACAATGCGTGATATGTGTACTGTGATCTTTAAACTCTCAGCAAAAGATAGTCCACTGGTAAGTGATATGGAGAAGCTATTGGCGTCGTCAAAAGATGGGGATTTGTATCTCAAGAAAAATGAGCTATTGAGATGGATAGATTTTGCTCAGACCTTCTTCAATAATCCAGCTGGGAATGTTGAGCTTAAGGCGCTTGAGGACTTGAATGAAGAGTTGATTACAAAGTCCGTTCTATT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778442.1
MASRTMDTTMRDMCTVIFKLSAKDSPLVSDMEKLLASSKDGDLYLKKNELLRWIDFAQTFFNNPAGNVELKALEDLNEELITKSVLLGNGLKPSVADVYVYATSHSCVKRLSSSDRERMPHLLRWVDYIQNQEDIQPILDKIVVEKAGFVPPVSKPIKKVEDSKQEPKEAGKSETVSKGKKIADTKKIEESQTSEAKKKLPEKVVEKKDEELSVSLLKIQIGHIRKAWKHPSADSLLVEEIDVGEAKCRQVVSGLAKFCT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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