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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002582`

染色体: Chr08 坐标: 25155962-25158589 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002582`
名称	SmilChr08G002582
描述	WRKY DNA-binding transcription factor 70
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25155962 - 25158589 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997218`
GeneID	`130997218`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997218`
原始查询	`LOC130997218`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	WRKY DNA-binding transcription factor 70
产物	WRKY DNA-binding transcription factor 70
Arabidopsis	`AT3G56400` (WRKY70) WRKY DNA-binding protein 70 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824807] identity=39.3; qcov=0.67; evalue=1.21e-36; confidence=medium
Rice	`Os05g0322900` (WRKY45) - identity=33.1; qcov=0.625; evalue=5.85e-23; confidence=low
GO	GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0043565 (sequence-specific DNA binding)
KEGG	-
Pfam	PF03106 (WRKY)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997218

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778451.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778451.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778451.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778451.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778451.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25157853`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,B107,C46
`Chr8:25157867`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C22
`Chr8:25157914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	4	B102,B11,B129,B62
`Chr8:25157914`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B11,B129,B62

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778451.1

286 aa

143

286

WRKY

PF03106 WRKY 120-179 aa

XP_057778452.1

285 aa

142

285

WRKY

PF03106 WRKY 119-178 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778451.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	120	179	3e-23	82.5	WRKY DNA -binding domain
`XP_057778452.1`	Pfam	`PF03106`	WRKY	Domain	119	178	3e-23	82.5	WRKY DNA -binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922468.1
AGAAAAAATGAAAAGGAAAAAAGGATGATCCACCAGCAAGTAATTTCTTAGTGCATTATTGGTAGCATACAAATATAGTACAGTTTTATATCGCAGATCTAGAAAACTGGTCCACCAATACCCACACGCCGTTGATCCGTTTCCCACAGCTGCACTCAACGGTCACGATCGACGGACTTGGAACTGCCAATCCCAAACCCGGAAAAACAGATCACCTCCAAAGCAACGTCCGCACGTGACGTCGGATACCTCACGTCACC...

XM_057922469.1
GCAAGTAATTTCTTAGTGCATTATTGGTAGCATACAAATATAGTACAGTTTTATATCGCAGATCTAGAAAACTGGTCCACCAATACCCACACGCCGTTGATCCGTTTCCCACAGCTGCACTCAACGGTCACGATCGACGGACTTGGAACTGCCAATCCCAAACCCGGAAAAACAGATCACCTCCAAAGCAACGTCCGCACGTGACGTCGGATACCTCACGTCACCGATTCCTTGTCTTTTTATTTTTTTCCTTCTCCCAT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997218
ATGGGGAGCTTGAGTTTCGATAATTTTCATGCAAGGAAGAAAAAAGCTATGGTGGAGCTGGTGAAGGGCAAGGAAATCGCAGTCCAGCTGCAAACCCTACTCCACAAACCAGTTTCGGATCGCGGTCCGGTTTCGCCCAAGCAACTCGCCGTCCTAATCTACAGATCCTTCTCCGATACTCTCTCGGAGCTCAGCTCCTGCACTACCCCGCCCGACTCGGACCAGATCCCGGCCGCTGAAGGCTCCTCCGCCTGCTCCGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778451.1
MGSLSFDNFHARKKKAMVELVKGKEIAVQLQTLLHKPVSDRGPVSPKQLAVLIYRSFSDTLSELSSCTTPPDSDQIPAAEGSSACSAESPKKKRGVKDRRGCYKRRRTSDSWVTRSPTIEDNYAWRKYGQKTIMNSEYPRSYFRCTHKQEGCKALKQVQRIKGDEIMYQTTYLNHHSCKETLRPPPLLVNSDPIDPNLISFQTPKQDQIQSSKKLTVKCEECVSEGASNEAKSTLEDPWHDITGLDPLGYKPLWFPYQDE...

XP_057778452.1
MGSLSFDNFHARKKKAMVELVKGKEIAVQLQTLLHKPVSDRGPVSPKQLAVLIYRSFSDTLSELSSCTTPPDSDQIPAAEGSSACSAESPKKKRGVKDRRGCYKRRTSDSWVTRSPTIEDNYAWRKYGQKTIMNSEYPRSYFRCTHKQEGCKALKQVQRIKGDEIMYQTTYLNHHSCKETLRPPPLLVNSDPIDPNLISFQTPKQDQIQSSKKLTVKCEECVSEGASNEAKSTLEDPWHDITGLDPLGYKPLWFPYQDEV...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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