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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及有 accession 序列支持的文献基因名查询；未闭环名称仅提供候选导航。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002583`

染色体: Chr08 坐标: 25172955-25176409 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002583`
名称	SmilChr08G002583
描述	rhodanese-like domain-containing protein 7
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25172955 - 25176409 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997219`
GeneID	`130997219`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997219`
原始查询	`LOC130997219`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhodanese-like domain-containing protein 7
产物	rhodanese-like domain-containing protein 7
Arabidopsis	`AT2G40760` (AT2G40760) Rhodanese/Cell cycle control phosphatase superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818672] identity=69.88; qcov=0.83; evalue=0.0; confidence=high
Rice	`Os05g0323100` (OsStr17) - identity=73.85; qcov=0.771; evalue=0.0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00581 (Rhodanese); PF17773 (UPF0176_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997219

打开注释模块

非零投票定位候选（最多五项）

Rank	定位位置	中文	五折投票比例	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778454.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.40000	`XP_057778454.1`
3	Mitochondrion	线粒体	0.20000	`XP_057778454.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25173227`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A23,B45,C87
`Chr8:25173534`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:25174208`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27
`Chr8:25175213`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B102,B11
`Chr8:25175217`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,C8
`Chr8:25175297`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A11,B61
`Chr8:25175875`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B125,C21,C36

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778454.1

477 aa

238

477

UPF0176_N

Rhodanese

PF17773 UPF0176_N 110-222 aa PF00581 Rhodanese 248-365 aa

XP_057778455.1

471 aa

236

471

UPF0176_N

Rhodanese

PF17773 UPF0176_N 110-222 aa PF00581 Rhodanese 243-359 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778454.1`	Pfam	`PF17773`	UPF0176_N	Domain	110	222	8.1e-22	78.1	UPF0176 acylphosphatase like domain
`XP_057778454.1`	Pfam	`PF00581`	Rhodanese	Domain	248	365	2.9e-06	28.4	Rhodanese-like domain
`XP_057778455.1`	Pfam	`PF17773`	UPF0176_N	Domain	110	222	7.9e-22	78.2	UPF0176 acylphosphatase like domain
`XP_057778455.1`	Pfam	`PF00581`	Rhodanese	Domain	243	359	1.1e-07	32.9	Rhodanese-like domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922472.1
CGATCGTGAAATCACAAATTTTCGAATCGACCAAACACCATTTCAAAGCCAACCAAAAACCGACCAATTTGATTGATTTGGTCGATGGGTCCGGTTTTTTGCAGAGGCCCAGACGCGAAGCGAAGACTCCAAAACCCGACTATTGTTTCTCCTTGCCTCCAATATGAAGTGTAGTATGCAGATCTTGATGGAAGCCATGGCCAATTGGAATCTACCAACAAGAGAATGGTTTTATTAGCTCACCATGTTTCGATACATCC...

XM_057922471.1
GACCAAACACCATTTCAAAGCCAACCAAAAACCGACCAATTTGATTGATTTGGTCGATGGGTCCGGTTTTTTGCAGAGGCCCAGACGCGAAGCGAAGACTCCAAAACCCGACTATTGTTTCTCCTTGCCTCCAATATGAAGTGTAGTATGCAGATCTTGATGGAAGCCATGGCCAATTGGAATCTACCAACAAGAGAATGGTTTTATTAGCTCACCATGTTTCGATACATCCCTACTCTCTCCTCCTCAACAAAAGAACT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057778454.1_43689
ATGGTTTTATTAGCTCACCATGTTTCGATACATCCCTACTCTCTCCTCCTCAACAAAAGAACTGCTTCTGCGGCGGCGCTCAGAATGCTATCTTCTTCTTCTTCTACCTCCTCAATAAACCCAAATCCCTCTCTCGCCATTCCCCCTTCCGCCATGACAAAATCCAATACACAAGTATCCACCAAATGTCCAAAATTTCCCCCTCTCCCCGATTCTGTTCAAGCCCTTTTCGCCTCGCAGAGTCTTTCTCTCTCTAGCAC...

lcl|NC_080394.1_cds_XP_057778455.1_43690
ATGGTTTTATTAGCTCACCATGTTTCGATACATCCCTACTCTCTCCTCCTCAACAAAAGAACTGCTTCTGCGGCGGCGCTCAGAATGCTATCTTCTTCTTCTTCTACCTCCTCAATAAACCCAAATCCCTCTCTCGCCATTCCCCCTTCCGCCATGACAAAATCCAATACACAAGTATCCACCAAATGTCCAAAATTTCCCCCTCTCCCCGATTCTGTTCAAGCCCTTTTCGCCTCGCAGAGTCTTTCTCTCTCTAGCAC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778454.1
MVLLAHHVSIHPYSLLLNKRTASAAALRMLSSSSSTSSINPNPSLAIPPSAMTKSNTQVSTKCPKFPPLPDSVQALFASQSLSLSSTSATRSISVGATAAVAESLECPLVVVSFYKFADFPDHADLRRPLKQLCERLRVSGGIILAPEGINGSICGTCDSVEEVLNFIQADDRLKGLRCIESPVSPEEEAIHHGHMESSPLAAGEDAPFRWDHVRVKLKKEIVTLGMPSVSPTERVGTYVNPREWNNLISDPDTVLISLL...

XP_057778455.1
MVLLAHHVSIHPYSLLLNKRTASAAALRMLSSSSSTSSINPNPSLAIPPSAMTKSNTQVSTKCPKFPPLPDSVQALFASQSLSLSSTSATRSISVGATAAVAESLECPLVVVSFYKFADFPDHADLRRPLKQLCERLRVSGGIILAPEGINGSICGTCDSVEEVLNFIQADDRLKGLRCIESPVSPEEEAIHHGHMESSPLAAGEDAPFRWDHVRVKLKKEIVTLGMPSVSPTERVGTYVNPREWNNLISDPDTVVIDVR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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