当前解析结果
SmilChr08G002586| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002586 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002586 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002586 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 25187684 - 25188417 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997223 |
|---|---|
| GeneID | 130997223 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997223 |
| 原始查询 | LOC130997223 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830404]; symbol=AT5G05220; hit=AT5G05220; species=arabidopsis; confidence=low |
| 产物 | uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830404]; symbol=AT5G05220; hit=AT5G05220; species=arabidopsis; confidence=low |
| Arabidopsis | AT5G05220 (AT5G05220)uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830404] identity=53.9; qcov=0.478; evalue=1.02e-17; confidence=low |
| Rice | Os03g0334300- identity=73.3; qcov=0.221; evalue=1.14e-07; confidence=weak |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997223 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057778459.1 |
| 2 | Chloroplast stroma | 叶绿体基质 | 0.80000 | XP_057778459.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057778459.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778459.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778459.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:25188024 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B1,C16 |
Chr8:25188037 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 15 | A10,A7,B124,B24,B34,B45,B56,B60,B71,B89,C54,C59,C78,C85,D3 |
Chr8:25188101 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A6 |
Chr8:25188111 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | A11,A3 |
Chr8:25188196 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 5 | B138,B47,B55,C11,C69 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。