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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002590`

染色体: Chr08 坐标: 25234431-25237642 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002590`
名称	SmilChr08G002590
描述	thioredoxin H-type
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25234431 - 25237642 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997228`
GeneID	`130997228`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997228`
原始查询	`LOC130997228`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	thioredoxin H-type
产物	thioredoxin H-type
Arabidopsis	`AT3G08710` (TH9) thioredoxin H-type 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820018] identity=54.3; qcov=0.722; evalue=5.52e-52; confidence=high
Rice	`Os01g0168200` (OsTRXh7) - identity=53; qcov=0.691; evalue=1.36e-49; confidence=medium
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF00085 (Thioredoxin); PF00578 (AhpC-TSA); PF08534 (Redoxin); PF13098 (Thioredoxin_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997228

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	0.60000	`XP_057778470.1`
2	Endoplasmic reticulum	内质网	0.60000	`XP_057778471.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.40000	`XP_057778470.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778471.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778470.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25235046`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B33,B49,B98,C32,C68
`Chr8:25235603`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B79
`Chr8:25235694`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B121,B79
`Chr8:25237330`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr8:25237350`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:25237362`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:25237382`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	27	A18,B102,B106,B109,B11,B113,B117,B119,B12,B129,B13,B130,B25,B72,B73,B75,C12,C26,C27,C29,C30,C34,C37,C4,C72,C73,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778470.1

200 aa

100

200

Thioredoxin

Redoxin

Thioredoxin_2

AhpC-TSA

PF00085 Thioredoxin 91-188 aa PF08534 Redoxin 97-178 aa PF13098 Thioredoxin_2 97-183 aa PF00578 AhpC-TSA 98-182 aa

XP_057778471.1

194 aa

194

Thioredoxin

Redoxin

Thioredoxin_2

AhpC-TSA

PF00085 Thioredoxin 85-182 aa PF08534 Redoxin 91-172 aa PF13098 Thioredoxin_2 91-177 aa PF00578 AhpC-TSA 92-176 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778470.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	91	188	7.9e-24	84.4	Thioredoxin
`XP_057778470.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	97	178	7.8e-07	29.7	Redoxin
`XP_057778470.1`	Pfam	`PF13098`	Thioredoxin_2	Domain	97	183	1.4e-10	42.2	Thioredoxin-like domain
`XP_057778470.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	98	182	2.6e-08	34.6	AhpC/TSA family
`XP_057778471.1`	Pfam	`PF00085`	Thioredoxin	Domain	85	182	7.1e-24	84.5	Thioredoxin
`XP_057778471.1`	Pfam	`PF08534`	Redoxin	Domain	91	172	7.3e-07	29.8	Redoxin
`XP_057778471.1`	Pfam	`PF13098`	Thioredoxin_2	Domain	91	177	1.3e-10	42.3	Thioredoxin-like domain
`XP_057778471.1`	Pfam	`PF00578`	AhpC-TSA	Domain	92	176	2.4e-08	34.7	AhpC/TSA family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922488.1
ATTGTTGTCGTTTTCTTTTTCAATAGATTTTATATTAAAAAATATTTGGAATTGCGCAAAGGATTCTCAACACACCATAGTATTAATATGCTTCCATAAAGGGAGGGTTACAAAATTAAACTCAAATGTCATTATGGCTTCGATTTCTATTTTCTACAGTTCTTCTCCTCCCCTTTTCATCTGGGCATCTCGTTGACCGACCATCCTTTTTAATGTTGTTCTATCCAAAATTTCAAAATACTAAGGTCACTGGTGCAGTC...

XM_057922487.1
TCGTTTTCTTTTTCAATAGATTTTATATTAAAAAATATTTGGAATTGCGCAAAGGATTCTCAACACACCATAGTATTAATATGCTTCCATAAAGGGAGGGTTACAAAATTAAACTCAAATGTCATTATGGCTTCGATTTCTATTTTCTACAGTTCTTCTCCTCCCCTTTTCATCTGGGCATCTCGTTGACCGACCATCCTTTTTAATGTTGTTCTATCCAAAATTTCAAAATACTAAGGTCACTGGTGCAGTCCTTCCAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997228
ATGTCATTATGGCTTCGATTTCTATTTTCTACAGTTCTTCTCCTCCCCTTTTCATCTGGGCATCTCGTTGACCGACCATCCTTTTTAATGTTGTTCTATCCAAAATTTCAAAATACTAAGGTCACTGGTGCAGTCCTTCCACCAGGGTTCAGATGCGAGTGGATGGGACAGTGTTGGGCTAAGTCGTGCAAACGAAATGCTAATCATGATGCCAAGACACAACTTGCGGGTGGAAACAATGTCCATCTTATAACTACAAT...

LOC130997228
ATGTCATTATGGCTTCGATTTCTATTTTCTACAGTTCTTCTCCTCCCCTTTTCATCTGGGCATCTCGTTGACCGACCATCCTTTTTAATGTTGTTCTATCCAAAATTTCAAAATACTAAGGTCACTGGTGCAGTCCTTCCACCAGGGTTCAGATGCGAGTGGATGGGACAGTGTTGGGCTAAGGCTCTGGGTTTACTGAAGTCGTGCAAACGAAATGCTAATCATGATGCCAAGACACAACTTGCGGGTGGAAACAATGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778470.1
MSLWLRFLFSTVLLLPFSSGHLVDRPSFLMLFYPKFQNTKVTGAVLPPGFRCEWMGQCWAKALGLLKSCKRNANHDAKTQLAGGNNVHLITTMEKWEKETSEAKKEGKIVVVNFSASWCGPCRTIAPAFSELADKYTSVVFITIDVDELAELSAAWNVKATPMFFFLKDGRQLDKLVGANKPDLQKKVAAICGSNPNSPN

XP_057778471.1
MSLWLRFLFSTVLLLPFSSGHLVDRPSFLMLFYPKFQNTKVTGAVLPPGFRCEWMGQCWAKSCKRNANHDAKTQLAGGNNVHLITTMEKWEKETSEAKKEGKIVVVNFSASWCGPCRTIAPAFSELADKYTSVVFITIDVDELAELSAAWNVKATPMFFFLKDGRQLDKLVGANKPDLQKKVAAICGSNPNSPN

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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