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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002591`

染色体: Chr08 坐标: 25243918-25246258 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002591`
名称	SmilChr08G002591
描述	probable inactive receptor kinase At5g58300
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25243918 - 25246258 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997229`
GeneID	`130997229`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997229`
原始查询	`LOC130997229`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable inactive receptor kinase At5g58300
产物	probable inactive receptor kinase At5g58300
Arabidopsis	`AT5G58300` (AT5G58300) Leucine-rich repeat protein kinase family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835942] identity=54.6; qcov=0.991; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os07g0681100` - identity=52.5; qcov=0.957; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005515 (protein binding); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF00560 (LRR_1); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr); PF08263 (LRRNT_2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997229

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057778472.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778472.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778472.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778472.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778472.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25244185`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C53
`Chr8:25244185`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C53
`Chr8:25244485`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C8
`Chr8:25244803`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:25244812`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A8,B25,B84,C41
`Chr8:25245424`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A5,B57,B7
`Chr8:25245514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C13,C39,C83
`Chr8:25245556`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr8:25245667`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B108,C22
`Chr8:25245739`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr8:25245807`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	119	A10,A11,A14,A15,A18,A2,A20,A21,A25,A3,A5,A6,A7,B10,B102,B103,B107,B112,B115,B117,B118,B120,B122,B123,B13,B131,B133,B135,B137,B138,B14,B140,B16,B19,B2,B23,B27,B29,B30,B31,B32,B37,B42,B43,B44,B45,B46,B50,B51,B52,B53,B54,B55,B57,B6,B62,B63,B64,B67,B70,B71,B74,B75,B76,B78,B81,B82,B83,B87,B88,B89,B90,B92,B97,C1,C11,C13,C16,C23,C25,C30,C31,C32,C33,C35,C41,C42,C43,C45,C46,C47,C50,C51,C55,C57,C58,C59,C6,C60,C61,C62,C63,C64,C66,C67,C68,C69,C70,C71,C73,C74,C76,C80,C82,C9,D10,D3,D5,D9
`Chr8:25245817`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,C22

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778472.1

645 aa

322

645

LRRNT_2

LRR_1

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF08263 LRRNT_2 35-72 aa PF00560 LRR_1 103-124 aa PF00560 LRR_1 149-170 aa PF00560 LRR_1 195-215 aa PF00069 Pkinase 352-615 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 352-615 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778472.1`	Pfam	`PF08263`	LRRNT_2	Family	35	72	5.8e-07	30.4	Leucine rich repeat N-terminal domain
`XP_057778472.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	103	124	2.6e-12	45.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057778472.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	149	170	2.6e-12	45.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057778472.1`	Pfam	`PF00560`	LRR_1	Repeat	195	215	2.6e-12	45.0	Leucine Rich Repeat
`XP_057778472.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	352	615	1.2e-30	107.5	Protein kinase domain
`XP_057778472.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	352	615	6.2e-33	114.9	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922489.1
TGCACTGCATTGGTTTACTTGTTTTTGTTGCTTGTTTGAACAATCATGAAGTCATGATGTTCTTCCCTTAACAGAATCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTAATGCATGGTGCATTTTAGTTGTACATACTAGCTGCTTCACATTTTGACTTCCATTTGAATGGTCTTGGCAGCTGAAGCTTCTGCAAAAACAAGAAGAATGAAAGTTCTCATCAGCATTCTCCTCCTCCTATCACTCGCCACACACATCAATTCCGAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997229
ATGGTCTTGGCAGCTGAAGCTTCTGCAAAAACAAGAAGAATGAAAGTTCTCATCAGCATTCTCCTCCTCCTATCACTCGCCACACACATCAATTCCGATCTCAGCTCCGACACAGCCGCCCTTCTGGAATTCGCCGATGCGGTCCCGCACGTGCGTAATCTCAACTGGAACGCCGCAAATCCAATCTGCACTTCATGGATAGGCATCACTTGCTCCAACGACAATACCAGAGTCGCCGGAGTCCATCTCCCCGGCATCGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778472.1
MVLAAEASAKTRRMKVLISILLLLSLATHINSDLSSDTAALLEFADAVPHVRNLNWNAANPICTSWIGITCSNDNTRVAGVHLPGIGLFGEIPANTYRKLDALKVLSLRSNHLSGDLPSDILSLPSLQALYLQRNNFSGAIPLFLSPRLAVVDLSSNSLSGAIPPSLAELKRLAVLNLEFNSFTGNLPNLDIPTLKMLNVSYNSLNGSIPQSLAKFPASSFIGNADLSSAPSASSFAAPPQQGSSSSSPQSAKSRKLNTG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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