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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002600`

染色体: Chr08 坐标: 25342824-25356663 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002600`
名称	SmilChr08G002600
描述	uncharacterized SmilChr08G002600
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25342824 - 25356663 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997236`
GeneID	`130997236`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997236`
原始查询	`LOC130997236`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922407]; symbol=AT2G40815; hit=AT2G40815; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922407]; symbol=AT2G40815; hit=AT2G40815; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT2G40815` (AT2G40815) Calcium-dependent lipid-binding (CaLB domain) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:7922407] identity=56.3; qcov=0.557; evalue=1.4e-46; confidence=medium
Rice	`Os01g0818100` - identity=49.7; qcov=0.542; evalue=1.02e-39; confidence=medium
GO	GO:0006952 (defense response)
KEGG	-
Pfam	PF00168 (C2)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997236

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	0.60000	`XP_057778480.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057778481.1`
3	Nucleus	细胞核	0.20000	`XP_057778481.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057778481.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778480.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25343058`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A18
`Chr8:25343149`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C13,C39,C53,C83
`Chr8:25343174`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:25343175`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	24	A7,B102,B115,B117,B27,B31,B46,B53,B54,B57,B64,B67,B70,B74,B77,B83,C32,C42,C6,C62,C68,C73,C76,D10
`Chr8:25343249`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C13,C39,C53,C83
`Chr8:25348555`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C31,C80
`Chr8:25348572`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr8:25348578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:25348582`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B81,C35,C46
`Chr8:25348589`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	C31,C70
`Chr8:25348589`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	C31,C70
`Chr8:25356246`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B86

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778480.1

302 aa

151

302

PF00168 C2 7-101 aa

XP_057778481.1

271 aa

136

271

PF00168 C2 7-101 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778480.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	7	101	4.9e-09	37.1	C2 domain
`XP_057778481.1`	Pfam	`PF00168`	C2	Domain	7	101	3.8e-09	37.4	C2 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922497.1
GGAAGTAAAAGTTGGAACTTAAAATGCGAATGGTGACCCCTAATTTCTAAATAAGTAAATGAATGGAAAAAGGTGAAAGTAGGATTAAACATAAAGCAAGCTAACAAGGGAACATCTCTTTCTTCCATTATTGCCTTTGTGAAAGAAAGAAGGAAAAAAAGCAGAAGAGAATTAATGGGGAAGAAGACATGGGTGGAGGTGTGCCTCATCTCGGCTCGAGGCCTGCGGCGATCTTCATCTCTGTGGAAACTCCAATGGTA...

XM_057922498.1
AATAAGTAAATGAATGGAAAAAGGTGAAAGTAGGATTAAACATAAAGCAAGCTAACAAGGGAACATCTCTTTCTTCCATTATTGCCTTTGTGAAAGAAAGAAGGAAAAAAAGCAGAAGAGAATTAATGGGGAAGAAGACATGGGTGGAGGTGTGCCTCATCTCGGCTCGAGGCCTGCGGCGATCTTCATCTCTGTGGAAACTCCAATGGTACGCCGTTGGATGGATCCATCCCGACAACAAGTACTGCACCAAGATCGAC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997236
ATGGGGAAGAAGACATGGGTGGAGGTGTGCCTCATCTCGGCTCGAGGCCTGCGGCGATCTTCATCTCTGTGGAAACTCCAATGGTACGCCGTTGGATGGATCCATCCCGACAACAAGTACTGCACCAAGATCGACGCCTCTGGGACATCCAACCCCCTTTGGAAAACTGGGTTTTCTACGTCGCTTGAATTCCAACCGGACTTGGCTCTTCATGTTGAAGTTTATAGCAGAGATCCCATCTTTCTTCGAGAGACTCTCTT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778480.1
MGKKTWVEVCLISARGLRRSSSLWKLQWYAVGWIHPDNKYCTKIDASGTSNPLWKTGFSTSLEFQPDLALHVEVYSRDPIFLRETLFGSATILLKEFFDSDSPVDEVGSFQLRKNNSNKPLGFVDVSIRLSQDRENPASSYLGVDEGFNLDNLDGGIKDVSLQPSKHDLALPKSQQTYHMPIPPHHPPAPSYQPQPPPPSNMGYLSNFLPPNYSHHPPAASQSRPPPPPPAPSNVGYIPNFSPMTSSYVNMPTVAAARGV...

XP_057778481.1
MGKKTWVEVCLISARGLRRSSSLWKLQWYAVGWIHPDNKYCTKIDASGTSNPLWKTGFSTSLEFQPDLALHVEVYSRDPIFLRETLFGSATILLKEFFDSDSPVDEVGSFQLRKNNSNKPLGFVDVSIRLSQDRENPASSYLGLWFLLVGAFHTDVIRPMASMSHITEIAVLMRDSTLTILMAASKMYLCSLPSMIWLYPNPNKLITCPFLPTTLRHPVTSHSHLRRLIWDTFPIFYLQTTPTTLRQPASHDHRHHHRPR...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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