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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002609`

染色体: Chr08 坐标: 25464120-25466346 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002609`
名称	SmilChr08G002609
描述	ATP synthase subunit delta', mitochondrial-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25464120 - 25466346 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997248`
GeneID	`130997248`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997248`
原始查询	`LOC130997248`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ATP synthase subunit delta', mitochondrial-like
产物	ATP synthase subunit delta'%2C mitochondrial-like
Arabidopsis	`AT5G47030` (AT5G47030) ATPase, F1 complex, delta/epsilon subunit [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:834749] identity=70.2; qcov=1.01; evalue=6.27e-104; confidence=high
Rice	`Os07g0495200` (RMtATPd1) - identity=71; qcov=0.882; evalue=1.15e-95; confidence=high
GO	GO:0000275 (GO:0000275); GO:0015986 (proton motive force-driven ATP synthesis); GO:0046933 (proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism)
KEGG	smil00190 (Oxidative phosphorylation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage)); smil01100 (Metabolic pathways - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF02823 (ATP-synt_DE_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997248

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057778496.1`
2	Mitochondrion membrane	线粒体膜	1.00000	`XP_057778496.1`
3	Mitochondrion inner membrane	线粒体内膜	0.80000	`XP_057778496.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778496.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778496.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25464300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	21	A3,B121,B128,B14,B3,B33,B36,B38,B39,B5,B55,C25,C33,C36,C37,C45,C50,C63,C77,C83,C85
`Chr8:25464328`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:25464331`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B127,C53
`Chr8:25464385`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B30
`Chr8:25464386`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B29,B81,B91,C4
`Chr8:25464389`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B128,B4,C19,D10
`Chr8:25464445`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C53
`Chr8:25464483`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr8:25464498`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	C76,D8
`Chr8:25464498`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	2	C76,D8
`Chr8:25465823`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A2,A5,B80
`Chr8:25465849`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778496.1

203 aa

102

203

ATP-synt_DE_N

PF02823 ATP-synt_DE_N 72-152 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778496.1`	Pfam	`PF02823`	ATP-synt_DE_N	Domain	72	152	1.2e-18	67.5	ATP synthase, Delta/Epsilon chain, beta-sandwich domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922513.1
TTAACGAGCCTCAAATAAAGTCCCATTTCGGCAAATCTCATTTTACCAGTCCTCTCCTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCACACACACTCAAACACGCGCTCTGCCTCCCCAAAATGCTGCGACATGGTTCACGATCCCTCTTCGGCCGAGCTTCTGCCACATCCATGAGGTGGCGCCGCCAGTTTTCTACCGATCTCCAGGCGGAGACTGCCGAAGACGCCAAGTTTGTGGAATCCTGGAAGAAAATGAACCCCAATAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997248
ATGCTGCGACATGGTTCACGATCCCTCTTCGGCCGAGCTTCTGCCACATCCATGAGGTGGCGCCGCCAGTTTTCTACCGATCTCCAGGCGGAGACTGCCGAAGACGCCAAGTTTGTGGAATCCTGGAAGAAAATGAACCCCAATATGGACCCGCCGAAAACCCCATCGGCGTACATGAAACCTCGACCACCCACCCCATCCAACATTCCGTCGAAGCTCACTGTCAATTTGGTGCTTCCTTATGATTCTGTCTTATCCTC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778496.1
MLRHGSRSLFGRASATSMRWRRQFSTDLQAETAEDAKFVESWKKMNPNMDPPKTPSAYMKPRPPTPSNIPSKLTVNLVLPYDSVLSSKEVDMVIVPATTGQMGVLPGHVATIAELKPGILSVHEGNDVSKYFLSSGFAFVHANSVADIIAIEATPVDHLDPNLVQKGLAEFQQKLNTASTDVEKAEAQIGIDVHSALNAALTG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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