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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002621`

染色体: Chr08 坐标: 25558592-25565883 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002621`
名称	SmilChr08G002621
描述	polyadenylate-binding protein 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25558592 - 25565883 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997260`
GeneID	`130997260`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997260`
原始查询	`LOC130997260`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	polyadenylate-binding protein 1
产物	polyadenylate-binding protein 1
Arabidopsis	`AT5G51120` (PABN1) polyadenylate-binding protein 1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835186] identity=84.5; qcov=0.91; evalue=2.79e-83; confidence=high
Rice	`Os02g0757900` (P0471A11.31-2) - identity=69.6; qcov=1.01; evalue=2.84e-72; confidence=high
GO	GO:0003723 (RNA binding)
KEGG	smil03015 (mRNA surveillance pathway - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00076 (RRM_1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997260

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778505.1`
2	Nucleoplasm	核质	1.00000	`XP_057778505.1`
3	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778507.1`
4	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057778507.1`
5	Chromatin	染色质	0.20000	`XP_057778505.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25559172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr8:25559198`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr8:25559291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:25559443`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:25562250`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	16	B101,B107,B12,B133,B19,B50,B87,B91,C11,C14,C55,C69,C70,C74,D3,D6
`Chr8:25563795`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C51
`Chr8:25565066`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778505.1

231 aa

116

231

RRM_1

PF00076 RRM_1 107-175 aa

XP_057778506.1

230 aa

115

230

RRM_1

PF00076 RRM_1 106-174 aa

XP_057778507.1

157 aa

157

RRM_1

PF00076 RRM_1 33-101 aa

XP_057778508.1

156 aa

156

RRM_1

PF00076 RRM_1 32-100 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778505.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	107	175	9.4e-17	61.4	RNA recognition motif
`XP_057778506.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	106	174	9.3e-17	61.4	RNA recognition motif
`XP_057778507.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	33	101	5.2e-17	62.2	RNA recognition motif
`XP_057778508.1`	Pfam	`PF00076`	RRM_1	Domain	32	100	5.2e-17	62.2	RNA recognition motif

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

4 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922522.1
ATGTGTACATTAGATTTCTTAAAATCACTCAGAATTGGTAACATGAAATACTAGCCTCAATGTTTTTAAAAAAAAAAGTATAAGCAGGAATCTGACCGCTTTTCGATATTCATCAAAGTGAATACCATATGTGTTTCTTAAAAACAGAAATAAAAAAGATCTTCAGTCATTTCCCTCAAAGAAAATGATCTTCAAAGTCATGTCGCATAAAATTTTGCTTTTCTCTTTGTGAAAAAAAGGAAACAAAATCCACAAATTTA...

XM_057922523.1
GAATACCATATGTGTTTCTTAAAAACAGAAATAAAAAAGATCTTCAGTCATTTCCCTCAAAGAAAATGATCTTCAAAGTCATGTCGCATAAAATTTTGCTTTTCTCTTTGTGAAAAAAAGGAAACAAAATCCACAAATTTATGAACAAAGGAGAATGAATCCCTAAATTAAGACGAAAAACAAACCCTCCAAAAGTACAAGTAAAACCATAAAAACGACTATTTGATTTTGTTTCATACAAATTTCATTAACCCTCATTT...

CDS

4 records

下载 CDS FASTA

LOC130997260
ATGGAGCATCAGCAGCAGCACGAGCAAGACGACGACGTTTATGGCGGCGACCTGCCCGACGAGGATTACATGGAGTCCGAATTTGACCCTTCTGCCGACGCCGACGCCGACGCCGACGCTGATGCTGATGCTGAAGCCGCCTCTGAATCCAAAACGCAGGAGTTGGAGAGTATGAAGAAGAGGTTGCAGGAGATTGAGGAAGAAGCAGGCGCGCTTCGCGAAATGCAAGCCAAGGTTGAGAAGGAGATGGGGGCGAATCA...

Protein

4 records

下载 Protein FASTA

XP_057778505.1
MEHQQQHEQDDDVYGGDLPDEDYMESEFDPSADADADADADADAEAASESKTQELESMKKRLQEIEEEAGALREMQAKVEKEMGANQEEGGSSVSQAEKEEVDARSIYVGNVDYACTPEEVQQHFQSCGTVNRVTILTDKFGQPKGFAYVEFVEVEAVQNALLLNESELHGRQLKVSAKRTNIPGMKQYRGRRPNPYFGSRRPFMPGPPVYPPFSYGRVPRFRRPMRYRPY

XP_057778506.1
MEHQQQHEQDDDVYGGDLPDEDYMESEFDPSADADADADADADAEAASESKTQELESMKKRLQEIEEEAGALREMQAKVEKEMGANQEGGSSVSQAEKEEVDARSIYVGNVDYACTPEEVQQHFQSCGTVNRVTILTDKFGQPKGFAYVEFVEVEAVQNALLLNESELHGRQLKVSAKRTNIPGMKQYRGRRPNPYFGSRRPFMPGPPVYPPFSYGRVPRFRRPMRYRPY

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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