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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002627`

染色体: Chr08 坐标: 25643476-25646356 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002627`
名称	SmilChr08G002627
描述	uncharacterized SmilChr08G002627
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25643476 - 25646356 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997266`
GeneID	`130997266`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997266`
原始查询	`LOC130997266`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	U6 snRNA phosphodiesterase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835191]; symbol=AT5G51170; hit=AT5G51170; species=arabidopsis; confidence=high
产物	U6 snRNA phosphodiesterase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835191]; symbol=AT5G51170; hit=AT5G51170; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT5G51170` (AT5G51170) U6 snRNA phosphodiesterase-like protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:835191] identity=58.8; qcov=0.841; evalue=7.44e-96; confidence=high
Rice	`Os02g0651000` - identity=58.1; qcov=0.69; evalue=2.26e-75; confidence=high
GO	GO:0000175 (3'-5'-RNA exonuclease activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0034477 (U6 snRNA 3'-end processing)
KEGG	-
Pfam	PF09749 (HVSL)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997266

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778513.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778513.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778513.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778513.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778513.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25643754`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B121,B140,B79,D3
`Chr8:25643788`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C76,D8
`Chr8:25644063`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C19
`Chr8:25645273`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B140
`Chr8:25645285`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B120,B56,B96,C41
`Chr8:25645495`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:25645529`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B100,B49,B85
`Chr8:25645536`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:25645617`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A19,B100,B49,B85
`Chr8:25646042`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B6,C24,C26,C3,C52

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778513.1

277 aa

138

277

HVSL

PF09749 HVSL 31-271 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778513.1`	Pfam	`PF09749`	HVSL	Family	31	271	2.5e-54	184.9	Uncharacterised conserved protein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922530.1
TGTTGGGTAGTTTAACTCATGAACAATTTGAAAATTAGCAAGGGTCGAGAGATACAACTACCAAGTGAACCCGATTCACACCGGTTTGCCTCTAGTCGTGAGTGATAGACTCTTGAATTATCAATTTCTTTGTCACCTCTCGGAACTCAAAATCAAGAATCGACGAGAAGAATAACAGTCCCTTCACTTTTTCGTTATGAATTTACACTGAAAAAATCTTTCTACAATTGACTTGGTCTCTCGGAGTTGGCAGTGGATGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997266
ATGGACGCCTTGAGAGCATCGTATGGAGATATTTCGTCCGACTCCGATTCGGAATCAGGTCCGACCCGTATCTCGGACCCCTCCCCTCTCCCTCCGCCGCCCCTCTCTCTTCTGCAGCCGCCACATTCAGCTGGTATATCCGATATTTTCCAAAGAGATCATCCAAATCGAGTCCGTAGCTTCCCTCATGTCGAGGGTAATTACGCTTTGCATGTATATATCCCAGTGTATATTCCCGTTTCATCAAGAAAGGAGATAGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778513.1
MDALRASYGDISSDSDSESGPTRISDPSPLPPPPLSLLQPPHSAGISDIFQRDHPNRVRSFPHVEGNYALHVYIPVYIPVSSRKEIAPLLKRVAAAVNEFHVVDVDIPLSSLINDEQKLDQVVLGREFHVSLGRAVPIRVHQRDSLVAMLRQKLHSHKRYWIDFDKWDVFVNDDCTLTFLSLEVTGAGLAEIQKQIELVNGVYKLHNLPEFYQNPRPHISVAWATGDISDSLKSVIGAEVKRRIGVSSNKRIFSCKFGGI...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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