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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002633`

染色体: Chr08 坐标: 25732874-25738968 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002633`
名称	SmilChr08G002633
描述	peptide methionine sulfoxide reductase A1-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25732874 - 25738968 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997272`
GeneID	`130997272`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997272`
原始查询	`LOC130997272`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	peptide methionine sulfoxide reductase A1-like
产物	peptide methionine sulfoxide reductase A1-like
Arabidopsis	`AT4G25130` (PMSR4) peptide met sulfoxide reductase 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:828616] identity=66; qcov=1.02; evalue=1.76e-119; confidence=high
Rice	`Os10g0563600` (OsMSRA4) - identity=82.7; qcov=0.731; evalue=5.51e-113; confidence=high
GO	GO:0005737 (cytoplasm); GO:0008113 (peptide-methionine (S)-S-oxide reductase activity); GO:0034599 (cellular response to oxidative stress); GO:0036456 (GO:0036456)
KEGG	-
Pfam	PF01625 (PMSR)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997272

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778521.1`
2	Chloroplast stroma	叶绿体基质	0.80000	`XP_057778521.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778521.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778521.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778521.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25738735`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	C4
`Chr8:25738735`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	C4
`Chr8:25738808`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A6,B6,C25,C9

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778521.1

245 aa

122

245

PMSR

PF01625 PMSR 81-225 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778521.1`	Pfam	`PF01625`	PMSR	Domain	81	225	6.6e-57	193.0	Peptide methionine sulfoxide reductase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922538.1
ATGATATTTGTGCTCGCGCTAAATAAGAATTTGTTTGAATATCGACGCGTAGAAACCAAACCCCAATACGTCATCTCTGTCTTCTCAAAACGACAGCTACAACCACCATGTCCATAGCCACACCCCAACTCTCCTCCCTCTTCAAACCCCCTTTCTCCATCCCCAAACTCAAACCCTTGAATCCCCCCCTCAAATTCCCCGCTCTCAAACCCTCTCCCCTCACTATGAGCTGGCTCAACAAGCTAGGCTTCGGCGTCCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997272
ATGTCCATAGCCACACCCCAACTCTCCTCCCTCTTCAAACCCCCTTTCTCCATCCCCAAACTCAAACCCTTGAATCCCCCCCTCAAATTCCCCGCTCTCAAACCCTCTCCCCTCACTATGAGCTGGCTCAACAAGCTAGGCTTCGGCGTCCGCTCCGCCGCCGACTCCCCCCTCGACTCCTCCTCCGCCGCCATAGCTCAGGGCCCCGACGACAACATACCCGCTCCCGGCCACCAGTTCGCCCAATTCGGATTGGGCTG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778521.1
MSIATPQLSSLFKPPFSIPKLKPLNPPLKFPALKPSPLTMSWLNKLGFGVRSAADSPLDSSSAAIAQGPDDNIPAPGHQFAQFGLGCFWGPELAYQRVPGVTKTEVGYSQGYLHNPTYEDICSGKTNHSEVVRVQYDPKECTYDALLDVFWARHDPTTPNRQGNDVGTQYRSGIYFYTPEQEKAALESRDRQQKLLNRTIVTEILPAKKFYRAEEYHQQYLAKGGRFGFRQSSEKGCNDPIRCYG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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