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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002637`

染色体: Chr08 坐标: 25814539-25817905 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002637`
名称	SmilChr08G002637
描述	probable transcription factor At5g61620
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	25814539 - 25817905 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997277`
GeneID	`130997277`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997277`
原始查询	`LOC130997277`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable transcription factor At5g61620
产物	probable transcription factor At5g61620
Arabidopsis	`AT5G61620` (AT5G61620) myb-like transcription factor family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836284] identity=47; qcov=0.745; evalue=1.57e-34; confidence=medium
Rice	`Os05g0195700` - identity=44.2; qcov=0.77; evalue=4.07e-32; confidence=medium
GO	GO:0003677 (DNA binding); GO:0009723 (response to ethylene); GO:0009733 (response to auxin); GO:0009739 (response to gibberellin)
KEGG	-
Pfam	PF00249 (Myb_DNA-binding)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997277

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778525.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778525.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778525.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778525.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778525.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:25814852`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:25814887`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:25816592`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:25817699`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B48,B68

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778525.1

239 aa

120

239

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 88-134 aa

XP_057778526.1

217 aa

108

217

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 88-134 aa

XP_057778527.1

200 aa

100

200

Myb_DNA-binding

PF00249 Myb_DNA-binding 88-134 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778525.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	88	134	3e-11	44.0	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057778526.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	88	134	2.5e-11	44.2	Myb-like DNA-binding domain
`XP_057778527.1`	Pfam	`PF00249`	Myb_DNA-binding	Domain	88	134	2.2e-11	44.4	Myb-like DNA-binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922542.1
GTCTTCCTGGACTGTTCCTTTGAAACCGCGCCTCTTTCTCTCTCTTTATCTTTATCTCTCTCCCTCTCTATAAATACCCTATCCTTCATACGTATTTTTTGCGTGTGTAAATAATTTATCACATATTTAGAGAGAAGATCTGTATATGTTACAAATATGAGTAACAGAAAGCGTGTGGAAGACGAGCCAGGCAACACTCAAATATTCAAGAAAGGTTGCAGCGAGATTAAGCTATTTGGCGTGCCGATCACTGTGCCGAG...

XM_057922544.1
CCTCTCTATAAATACCCTATCCTTCATACGTATTTTTTGCGTGTGTAAATAATTTATCACATATTTAGAGAGAAGATCTGTATATGTTACAAATATGAGTAACAGAAAGCGTGTGGAAGACGAGCCAGGCAACACTCAAATATTCAAGAAAGGTTGCAGCGAGATTAAGCTATTTGGCGTGCCGATCACTGTGCCGAGCGACGGCGGCGGCGGCGGCTCAGCCTCCATGAGAAAGTGCAAGAGCATGGATAACTTAGAGG...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130997277
ATGAGTAACAGAAAGCGTGTGGAAGACGAGCCAGGCAACACTCAAATATTCAAGAAAGGTTGCAGCGAGATTAAGCTATTTGGCGTGCCGATCACTGTGCCGAGCGACGGCGGCGGCGGCGGCTCAGCCTCCATGAGAAAGTGCAAGAGCATGGATAACTTAGAGGCATGCGCCTCCGCCTCCGCCGCCGAAGAACCCTCAGGATATCTATCCGATGGATTTGTTCATCAATATTCTAAATCACACCAAAGAAAGCCAGG...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057778525.1
MSNRKRVEDEPGNTQIFKKGCSEIKLFGVPITVPSDGGGGGSASMRKCKSMDNLEACASASAAEEPSGYLSDGFVHQYSKSHQRKPGKPWSEEEHRSFLEGLEKLGKGDWKGIASKFVPSRKSSQVASHAQKYFNRLNLTASNKKRRRGSVFDIHPTHTNAASSSAAASKNIGEHKLQPHVERPPLSPMQPDFHGLIYLQPSASGLTKWYPAAQAVIPNSPSLAACGVFTTPECFFWAQ

XP_057778526.1
MSNRKRVEDEPGNTQIFKKGCSEIKLFGVPITVPSDGGGGGSASMRKCKSMDNLEACASASAAEEPSGYLSDGFVHQYSKSHQRKPGKPWSEEEHRSFLEGLEKLGKGDWKGIASKFVPSRKSSQVASHAQKYFNRLNLTASNKKRRRGSVFDIHPTHTNAASSSAAASKNIGEHKLQPSASGLTKWYPAAQAVIPNSPSLAACGVFTTPECFFWAQ

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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