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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G001021`

染色体: Chr01 坐标: 21385854-21388451 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G001021`
名称	SmilChr01G001021
描述	uncharacterized SmilChr01G001021
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	21385854 - 21388451 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997278`
GeneID	`130997278`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997278`
原始查询	`LOC130997278`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=weak
产物	hit=Os11g0307600; species=rice; confidence=weak
Arabidopsis	`-` -
Rice	`Os11g0307600` - identity=22.1; qcov=0.565; evalue=5.24e-11; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF29561 (DUF8566)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997278

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778563.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778563.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778563.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778563.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778563.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:21385880`	`C`	`CT`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	A10,B124,B135,B70,C33,D7
`Chr1:21386253`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B108,B119,B122,B81
`Chr1:21386258`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	B101,B113,B138,B45,B53,B6,B60,B62,C14,C25,C39,C63,C67
`Chr1:21386279`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B50
`Chr1:21386279`	`CG`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B50
`Chr1:21386306`	`CA`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	28	A10,A3,B111,B112,B117,B133,B14,B140,B22,B23,B27,B48,B5,B51,B57,B69,B95,B99,C17,C26,C29,C32,C44,C56,C6,C68,D1,D6
`Chr1:21386477`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,C35,C37
`Chr1:21387204`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C49
`Chr1:21387384`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A15,A23,C82
`Chr1:21387385`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C12,D11,D6
`Chr1:21387666`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B40,C52
`Chr1:21387712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C12,D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778563.1

393 aa

196

393

DUF8566

PF29561 DUF8566 175-375 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778563.1`	Pfam	`PF29561`	DUF8566	Domain	175	375	3.9e-50	171.2	Domain of unknown function (DUF8566)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922580.1
ATGGCAATAACAAAGGGTAGTAATACCGGAAATCGTACAAAAAAGGACAAGGGAAAAAACATTGTTGACGGGTCGGCAATCCGTGATGGTAGTATTGCTTCAAAAAAAGGGACGCCCAAAAGCAAAGCAAAAGGGAAAGGTGTGAATGATGCTAATGATTTCGTTGAGGGTAGTCCTCGCGTTACAAGAGGTAGTGTGAAGGGAAAAGAGAAAGTGGCTACTTACAGAAAGGGGAAAGAGGCGAATTTAGGCGATGCACG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997278
ATGGCAATAACAAAGGGTAGTAATACCGGAAATCGTACAAAAAAGGACAAGGGAAAAAACATTGTTGACGGGTCGGCAATCCGTGATGGTAGTATTGCTTCAAAAAAAGGGACGCCCAAAAGCAAAGCAAAAGGGAAAGGTGTGAATGATGCTAATGATTTCGTTGAGGGTAGTCCTCGCGTTACAAGAGGTAGTGTGAAGGGAAAAGAGAAAGTGGCTACTTACAGAAAGGGGAAAGAGGCGAATTTAGGCGATGCACG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778563.1
MAITKGSNTGNRTKKDKGKNIVDGSAIRDGSIASKKGTPKSKAKGKGVNDANDFVEGSPRVTRGSVKGKEKVATYRKGKEANLGDARLNEVRTKYRNDPALLAFKRSILGGEILKRKLGETSGKDAAGSLVVHDVGVVSPVAPAKRKRIDKRKLAVGNYTKLQVKSYDDYPSLYIRSTPCVLLKAVKEMNDVQKEAVKSLGFGSVLDLTIQEMPSKLDYWVLDCFHARRSEIVLPSGKTIEVTDEDAYRVLGFPRGDRSL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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