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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002665`

染色体: Chr08 坐标: 26136274-26139487 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002665`
名称	SmilChr08G002665
描述	conserved oligomeric Golgi complex subunit 4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26136274 - 26139487 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997301`
GeneID	`130997301`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997301`
原始查询	`LOC130997301`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	conserved oligomeric Golgi complex subunit 4
产物	conserved oligomeric Golgi complex subunit 4
Arabidopsis	`AT4G01395` (AT4G01395) conserved oligomeric Golgi complex subunit 4 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827943] identity=74.7; qcov=0.993; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os02g0456000` (EIP4) - identity=58; qcov=0.729; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF08318 (COG4_m); PF20662 (COG4_C); PF20663 (COG4_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997301

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057778555.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057778555.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057778555.1`
4	Endocytic vesicle	Endocytic vesicle	0.20000	`XP_057778555.1`
5	Clathrin-coated vesicle	Clathrin-coated vesicle	0.20000	`XP_057778555.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26136692`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:26136913`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B41,C73
`Chr8:26136913`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B41,C73
`Chr8:26137270`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:26137624`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A21
`Chr8:26137624`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	A21
`Chr8:26138736`	`GA`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B127
`Chr8:26138736`	`GA`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B127
`Chr8:26138835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C13,C39,C83,D6
`Chr8:26138901`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B28

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778555.1

745 aa

372

745

COG4_N

COG4_m

COG4_C

PF20663 COG4_N 77-170 aa PF08318 COG4_m 212-486 aa PF20662 COG4_C 511-727 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778555.1`	Pfam	`PF20663`	COG4_N	Repeat	77	170	7e-26	91.1	Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, N-terminal
`XP_057778555.1`	Pfam	`PF08318`	COG4_m	Repeat	212	486	8e-77	259.0	COG4 transport protein, middle alpha-helical bundle
`XP_057778555.1`	Pfam	`PF20662`	COG4_C	Repeat	511	727	8e-63	213.0	Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, C-terminal

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922572.1
ATTTAGTGGTGTTTTAGGGGTTTGGAGTGAGAAAGATGGCTCTAATGGCGCTGACACCGCGAAGCGAAGCAGACGGTGATGCTTCGTCGGGCAATTATTCGTCGTCTCTGCAATTTGGCACGGCGGAGGCGCTGGAACATGTTCGCAAACTCACCGATGTTGGTGCCATGACCCGTTTTCTGCATGAATGCATAGCCTACCAGCGAGCCCTAGATCTGGAGCTCGAAAGCTTACTTTCCCAGCGCTCCGACTTAGATCGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997301
ATGGCTCTAATGGCGCTGACACCGCGAAGCGAAGCAGACGGTGATGCTTCGTCGGGCAATTATTCGTCGTCTCTGCAATTTGGCACGGCGGAGGCGCTGGAACATGTTCGCAAACTCACCGATGTTGGTGCCATGACCCGTTTTCTGCATGAATGCATAGCCTACCAGCGAGCCCTAGATCTGGAGCTCGAAAGCTTACTTTCCCAGCGCTCCGACTTAGATCGCCAACTTTCCAACCTCCACAAATCCGCCGATGTTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778555.1
MALMALTPRSEADGDASSGNYSSSLQFGTAEALEHVRKLTDVGAMTRFLHECIAYQRALDLELESLLSQRSDLDRQLSNLHKSADVLQIVKGDSSYMLSNISSTSSLADQVSAKVRHLDLAQSRVQDTLLRIDAIVDRSNCLDGVHKSLLAEDFESGASYIQTFLQIDFKFKDSSAADQRQQLLSYKKQLEGIVKKRLSEAVDHRDHPTILRFIKLFKPLGLEEEGLQIYVSYLKKVISSRSKEEFEQLLEQIEQSNNNS...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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