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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003863`

染色体: Chr01 坐标: 56891702-56895406 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003863`
名称	SmilChr01G003863
描述	putative UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 3
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56891702 - 56895406 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997329`
GeneID	`130997329`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997329`
原始查询	`LOC130997329`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	putative UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 3
产物	putative UDP-glucuronate:xylan alpha-glucuronosyltransferase 3
Arabidopsis	`AT1G77130` (PGSIP2) plant glycogenin-like starch initiation protein 2 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:844049] identity=68.2; qcov=0.992; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0880200` (P0018C10.44-1) - identity=65.8; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0016757 (glycosyltransferase activity); GO:0045492 (xylan biosynthetic process)
KEGG	-
Pfam	PF01501 (Glyco_transf_8); PF28720 (GUX1-5_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997329

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057778601.1`
2	Golgi stack	高尔基堆	0.20000	`XP_057778601.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.20000	`XP_057778601.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778608.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778608.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56891884`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B32,B84,C38,C75
`Chr1:56891931`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A2,A20,A4,D10
`Chr1:56892043`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C76
`Chr1:56892300`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B22,B41
`Chr1:56892409`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	6	B118,B122,B140,B17,B37,B52
`Chr1:56892485`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	81	A1,A13,A16,A3,A5,A6,B102,B105,B115,B118,B120,B121,B124,B128,B131,B132,B136,B139,B17,B18,B20,B29,B31,B35,B36,B37,B46,B53,B55,B56,B57,B60,B64,B65,B66,B69,B7,B76,B79,B8,B83,B85,B90,B91,B95,B97,B98,C1,C11,C12,C13,C16,C18,C21,C23,C3,C30,C31,C34,C36,C38,C39,C42,C45,C46,C47,C48,C53,C56,C58,C64,C65,C67,C70,C72,C76,C80,C82,C9,D10,D8
`Chr1:56892486`	`GGT`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	74	A13,A3,A5,B105,B115,B120,B121,B124,B128,B132,B136,B139,B17,B18,B20,B29,B31,B35,B36,B37,B46,B53,B55,B56,B57,B60,B64,B65,B66,B69,B7,B76,B79,B8,B83,B85,B90,B95,B97,B98,C1,C11,C12,C13,C16,C18,C21,C23,C3,C30,C31,C34,C36,C38,C39,C42,C45,C46,C47,C48,C53,C56,C58,C64,C65,C67,C70,C72,C76,C80,C82,C9,D10,D8
`Chr1:56892531`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C80
`Chr1:56892722`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr1:56893538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B64
`Chr1:56893829`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778601.1

647 aa

324

647

GUX1-5_N

Glyco_transf_8

PF28720 GUX1-5_N 105-292 aa PF01501 Glyco_transf_8 318-524 aa

XP_057778608.1

603 aa

302

603

GUX1-5_N

Glyco_transf_8

PF28720 GUX1-5_N 61-248 aa PF01501 Glyco_transf_8 274-480 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778601.1`	Pfam	`PF28720`	GUX1-5_N	Domain	105	292	3.3e-80	268.8	GUX1-5 N-terminal domain
`XP_057778601.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	318	524	5.4e-15	56.4	Glycosyl transferase family 8
`XP_057778608.1`	Pfam	`PF28720`	GUX1-5_N	Domain	61	248	3e-80	268.9	GUX1-5 N-terminal domain
`XP_057778608.1`	Pfam	`PF01501`	Glyco_transf_8	Family	274	480	4.7e-15	56.6	Glycosyl transferase family 8

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922618.1
TATAGATGAGATGCTGCCTTCTCTGAGTTGCGACTGAACCACCAGAAAAATGAGAGGCTCCTCGCCTACGTCACTGGAGTCCAGACACAGGCTCTCTTTCAATAATGATGATACAAGCAAAAGAAGGTTTCTAAGAAGTAGAGTGTTTAAAGATGGGGACAGGTCCCTTTATCGTTCCAGTATGGACAGGATATCGAGCTTCAAGTTCTCTACCTTGAAGGTTGTGATGGTCATCATCATAATTGGAGCATTTTTCACAT...

XM_057922625.1
TTGTATTCCATCTTCTTTTCTCTTGTTGGTTTTGGATTTTGTAGCTCGTTTTATGCAGTTCATTCCGAGATGTTTGCTTTTAGTTGTGGCTGGATCGTCAATTTTAGGATTCTTTGATATCAACGATTCAATTATTTGGAATGTAATAAACAGAGGCCATGGCGGTGGCCGACGGTGGTGGGTCTAATTCTTTCTCTCAGTGTATAATGAGAGTGGAATAAAATGGCTGGCACAGAGTTATGGTGTCTGAGATTGTCGGT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997329
ATGAGAGGCTCCTCGCCTACGTCACTGGAGTCCAGACACAGGCTCTCTTTCAATAATGATGATACAAGCAAAAGAAGGTTTCTAAGAAGTAGAGTGTTTAAAGATGGGGACAGGTCCCTTTATCGTTCCAGTATGGACAGGATATCGAGCTTCAAGTTCTCTACCTTGAAGGTTGTGATGGTCATCATCATAATTGGAGCATTTTTCACATTTCTACGTCCTCCATCAATTCATGATTCAGATCATATGTCCCGTTCTCG...

LOC130997329
ATGGACAGGATATCGAGCTTCAAGTTCTCTACCTTGAAGGTTGTGATGGTCATCATCATAATTGGAGCATTTTTCACATTTCTACGTCCTCCATCAATTCATGATTCAGATCATATGTCCCGTTCTCGATATAGGTACTTGGTCGATAAAGGAATAAGTGATAGATTTGGCATAGATCAAAGTTACACATCACATTTAGATATCGACTGGGATGAAGCATCGGCAGCAATGGAGAGATTAACCGACAGGGATGAGTATAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778601.1
MRGSSPTSLESRHRLSFNNDDTSKRRFLRSRVFKDGDRSLYRSSMDRISSFKFSTLKVVMVIIIIGAFFTFLRPPSIHDSDHMSRSRYRYLVDKGISDRFGIDQSYTSHLDIDWDEASAAMERLTDRDEYKGIGLLNFNEEEISQWKQLLPDADHIVLFTDYASPNVTWETLYPEWLDEEEDFDIPTCPSLPKIHYLGKPRLDLIAVKLPCDKSKKNWARDIARFHLQLEAARVAATAKGYHPVHLLLITECFPTPNLFT...

XP_057778608.1
MDRISSFKFSTLKVVMVIIIIGAFFTFLRPPSIHDSDHMSRSRYRYLVDKGISDRFGIDQSYTSHLDIDWDEASAAMERLTDRDEYKGIGLLNFNEEEISQWKQLLPDADHIVLFTDYASPNVTWETLYPEWLDEEEDFDIPTCPSLPKIHYLGKPRLDLIAVKLPCDKSKKNWARDIARFHLQLEAARVAATAKGYHPVHLLLITECFPTPNLFTCKELTVREGNVWLYKPNLNKLREKLNLPVGSCELAVPLKTEENW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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