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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002720`

染色体: Chr08 坐标: 26831349-26834139 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002720`
名称	SmilChr08G002720
描述	transcription factor MTB1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26831349 - 26834139 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997349`
GeneID	`130997349`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997349`
原始查询	`LOC130997349`

查看完整 ID 对照表

已核对的文献基因名映射

这些条目来自人工核对的文献基因名与当前参考基因组的映射。置信度反映映射证据强度，不代表该功能已在本材料中完成实验验证。

文献基因名	映射置信度	映射证据	文献功能摘要
`SmMYC2`	low	BLASTX top hit to bHLH/MYC-like protein; 32.8% identity, 86% query coverage	JA-responsive regulator of tanshinone/phenolic-acid pathway genes.

文献序列与新 ID 证据

这些记录来自论文中明确给出的 accession，并通过序列比对映射到当前参考版本。网站定位属于计算预测；论文中的实验定位和互作单独列出。

论文基因名	Accession	当前 ID	比对	置信度	来源
`SmJRB1` P025; 2021	`MT921839`	`LOC130997349` `SmilChr08G002720` GeneID 130997349	nucleotide; identity 99.452%; coverage 100.0%	Exact or near-exact sequence match	DOI

打开完整文献证据

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	transcription factor MTB1
产物	transcription factor MTB1
Arabidopsis	`AT1G01260` (AT1G01260) basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:839545] identity=51.3; qcov=1.04; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os01g0235700` (OsbHLH008) - identity=41.9; qcov=1.04; evalue=4.03e-144; confidence=medium
GO	GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription); GO:0046983 (protein dimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00010 (HLH); PF14215 (bHLH-MYC_N); PF23177 (bHLH_IRO3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997349

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778623.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778623.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778623.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778623.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778623.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26832569`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:26832573`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:26832614`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr8:26832742`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B30,B65,C64,C66,D11
`Chr8:26832813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:26833656`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:26833664`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C20,D2
`Chr8:26833811`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B74,C73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778623.1

607 aa

304

607

bHLH-MYC_N

HLH

bHLH_IRO3

PF14215 bHLH-MYC_N 46-234 aa PF00010 HLH 438-484 aa PF23177 bHLH_IRO3 441-500 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778623.1`	Pfam	`PF14215`	bHLH-MYC_N	Family	46	234	1.5e-54	185.8	bHLH-MYC and R2R3-MYB transcription factors N-terminal
`XP_057778623.1`	Pfam	`PF00010`	HLH	Domain	438	484	2.8e-12	46.9	Helix-loop-helix DNA-binding domain
`XP_057778623.1`	Pfam	`PF23177`	bHLH_IRO3	Domain	441	500	4.5e-09	37.3	Iron-related transcription factor 3 bHLH domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922640.1
GAAAAGAAAAAAAAGGAAAAAACAAGATTGTTGCCGACTGCACAAACTCTCTCTCTCACACACACACACTAACCATGGTTACTTTTTCACTGTTCTGCAAACCTCAAACCCAAACTTCATACACATGCAGCAATTTGGGCAAGAAAATTTAGAAACACAATACACAAACAGCTAACATATCTTCTTCCTTCTCTTCTGCTCTGCAAAAAAGAGAAAAGAGGCCGCAAATAAATTCTCCTTGTTTCCGCTGCTGATTATTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997349
ATGGGGGTTGTTGGTTGGAGTAATGAAGATAAGGCGATGGCAGCAGCGGTTTTGGGAACTAAGGCTTTTGATTACTTGATGTCGAGCTCAGTTTCTGCTGAATGCTCGTTAATGGCGATGGGGAGTGATGAGAATTTGCAGAATAAGCTTGCAGATCTTGTAGAGCGCCCAAATTCTTCCAATTTTTGTTGGAATTATGCAATTTTCTGGCAGCTCTCTAGGTCCAAGGCTGGGGACTTGGTGTTGGGATGGGGGGACGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778623.1
MGVVGWSNEDKAMAAAVLGTKAFDYLMSSSVSAECSLMAMGSDENLQNKLADLVERPNSSNFCWNYAIFWQLSRSKAGDLVLGWGDGCCREPRDDEESEVTRILKMRLEDESQQTMRKRVLQRLHTLFGGGDEENYAFGLDKVTDTEMFFLASMYFSFPRGEGGPGRCFGSGKYVWLSDSLKSSVDYCVRSFLAKSAGMQTIVLIPTDVGVVELGSVRCIPESMELVKVVGSSFSSFSSLLRSKQAAAAAVVTVTDKKDT...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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