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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002737`

染色体: Chr08 坐标: 26995063-26997014 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002737`
名称	SmilChr08G002737
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	26995063 - 26997014 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997367`
GeneID	`130997367`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997367`
原始查询	`LOC130997367`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	zinc finger CCCH domain-containing protein 1
产物	zinc finger CCCH domain-containing protein 1
Arabidopsis	`AT1G01350` (AT1G01350) Zinc finger (CCCH-type/C3HC4-type RING finger) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:838964] identity=69.7; qcov=0.967; evalue=2.33e-161; confidence=high
Rice	`Os02g0301000` (OsC3H15) - identity=66.6; qcov=0.958; evalue=1.8e-131; confidence=high
GO	GO:0005684 (U2-type spliceosomal complex); GO:0034247 (snoRNA splicing); GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00097 (zf-C3HC4); PF00642 (zf-CCCH); PF13920 (zf-C3HC4_3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997367

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778637.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.60000	`XP_057778637.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778637.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778637.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778637.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:26995197`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B38,B39,B76,C68
`Chr8:26996525`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B102

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778637.1

334 aa

167

334

zf-CCCH

zf-C3HC4_3

zf-C3HC4

PF00642 zf-CCCH 196-221 aa PF13920 zf-C3HC4_3 273-314 aa PF00097 zf-C3HC4 274-311 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778637.1`	Pfam	`PF00642`	zf-CCCH	Family	196	221	6.3e-10	39.4	Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar)
`XP_057778637.1`	Pfam	`PF13920`	zf-C3HC4_3	Domain	273	314	1.3e-08	35.2	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)
`XP_057778637.1`	Pfam	`PF00097`	zf-C3HC4	Domain	274	311	3e-05	24.5	Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922654.1
GCCCAAGACCAAGCCCATTGTATAACAAGCGATAAAACAATAGAATAGAAAAAAGAAAAAAAATAGCGGCAACGAAGAACAAAGAGGAAATCGCGGTCATGGCGGGAGAGGAAGCTGATGGAGGCTCCGCCGGCGCCGCCACCGGTGAGGGTTCTAACGTGTGTAGTTTCTTTAGGAAGCCATCAAAGGGGAAGAACATTAGGAAACGAACCGCCGTAGAAGAGGCAGAGGGTGCAGATGAAGATTCTAACTCGGGGAGC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997367
ATGGCGGGAGAGGAAGCTGATGGAGGCTCCGCCGGCGCCGCCACCGGTGAGGGTTCTAACGTGTGTAGTTTCTTTAGGAAGCCATCAAAGGGGAAGAACATTAGGAAACGAACCGCCGTAGAAGAGGCAGAGGGTGCAGATGAAGATTCTAACTCGGGGAGCTCAGTGGTGTATAATAAGAAGAAACAGGCTGCTGCTGACAACAAGTTGCTCTTCTCTAGCGGTTCGTTGAAGACTTCGAAAGGGTCTGAGCCCGAAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778637.1
MAGEEADGGSAGAATGEGSNVCSFFRKPSKGKNIRKRTAVEEAEGADEDSNSGSSVVYNKKKQAAADNKLLFSSGSLKTSKGSEPEKQKDSVFEYESSRVIQVQNDSKATATLETETDFSRDARAIRERVLKQAEAALKGKNKSSGDEKLYKGLHGYTDYKAGFRREQTVASEKAGGAHGPLRASAHIRVSARFDYQPDICKDYKETGYCGYGDSCKFMHDRGDYKSGWQLEKEWDEKEKARTRKMAMGMKGGEDDESPA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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