当前解析结果
SmilChr08G002746| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002746 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002746 |
| 描述 | MYB-like transcription factor ETC3 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 27077052 - 27078122 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130997373 |
|---|---|
| GeneID | 130997373 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997373 |
| 原始查询 | LOC130997373 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | MYB-like transcription factor ETC3 |
| 产物 | MYB-like transcription factor ETC3 |
| Arabidopsis | AT2G30420 (ETC2)Homeodomain-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817593] identity=62.7; qcov=0.713; evalue=5.17e-27; confidence=medium |
| Rice | Os01g0619100 (OsTCL1)- identity=59.3; qcov=0.574; evalue=6.34e-21; confidence=medium |
| GO | GO:0000976 (transcription cis-regulatory region binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0030154 (cell differentiation) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF00249 (Myb_DNA-binding) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997373 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057778642.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778642.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778642.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057778642.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057778642.1 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057778642.1PF00249
Myb_DNA-binding 27-67 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057778642.1 |
Pfam | PF00249 |
Myb_DNA-binding | Domain | 27 | 67 | 2e-10 | 41.3 | Myb-like DNA-binding domain |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。