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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002747`

染色体: Chr08 坐标: 27086880-27091271 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002747`
名称	SmilChr08G002747
描述	uncharacterized SmilChr08G002747
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27086880 - 27091271 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997374`
GeneID	`130997374`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997374`
原始查询	`LOC130997374`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837105]; symbol=AT1G05950; hit=AT1G05950; species=arabidopsis; confidence=low
产物	uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837105]; symbol=AT1G05950; hit=AT1G05950; species=arabidopsis; confidence=low
Arabidopsis	`AT1G05950` (AT1G05950) uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837105] identity=39.9; qcov=0.421; evalue=8.22e-61; confidence=low
Rice	`Os09g0514500` (ald) - identity=44.5; qcov=0.237; evalue=4.71e-30; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF25500 (DUF7913); PF25502 (DUF7915)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997374

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778643.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778643.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778643.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778643.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778643.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27088300`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B105
`Chr8:27088420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,C41,C84
`Chr8:27088513`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:27088514`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C48
`Chr8:27088578`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:27089626`	`TG`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	2	B129,C62
`Chr8:27089626`	`TG`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B129,C62
`Chr8:27089652`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C14
`Chr8:27089679`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A4,B74,C73,C8
`Chr8:27090361`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B94

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778643.1

692 aa

346

692

DUF7913

DUF7915

PF25500 DUF7913 6-125 aa PF25502 DUF7915 162-298 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778643.1`	Pfam	`PF25500`	DUF7913	Domain	6	125	3.2e-46	157.0	Domain of unknown function (DUF7913)
`XP_057778643.1`	Pfam	`PF25502`	DUF7915	Domain	162	298	9.1e-42	143.3	Domain of unknown function (DUF7915)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922660.1
TTCGAACGCATGCTGATACACACAGTCCCCTGCGCGCCTTTTTCAAGAAACCATCACACGCAGTGCACACACAGTGTGTGCTAGATAGCATTGAGTTTTGGTTGTTTGGAAACGCTTGTTTGGCGATTCCTCTTCTTAAAACTTCTGCCCTTCTTCTCAAACTTCCGTTTTCCAGTAAAAAGAAAAAATAACATTTTTTTTTCTCCCTTTGCTCTGATTTTTTGATCGCCGGAAATTTCTGTTCTGCTTGTTTTGGAGAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997374
ATGGAATCAAAATGGGAAGTAGGCCCAACAAATGATGTGATTCAGGCATTCCTCGATACTTTGGTTGCTCCGAGGTTGCCGTATCAGTCCTCCATTAACGACCCTCCTTCTGAAGAGGGTCACAAATCTATTGCAAGACAGATGCATGCAGTTGTTTTGCTTTACAACTATTACCATAGGAAGCAGAAACCAGAGTTGAAGTTTCTAGATTTTGTATCCTTCTGTAAGCTGGCTTTGTCACTGAAGCCAACTTTGAAACC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778643.1
MESKWEVGPTNDVIQAFLDTLVAPRLPYQSSINDPPSEEGHKSIARQMHAVVLLYNYYHRKQKPELKFLDFVSFCKLALSLKPTLKPFLITIHGSEAVELNGSEDHLSVTEKAVKSACDIAMSLDASKDDPTTEGYPISTVAVLLIDSERENCLLKCDAVAEGVWSLIEKEINEFSTGQEIRAEERAGKKRKLNDHSNFLQIGFDAVKDVAGIEVSDIEVLEAHVVYSLTKEKSAAQFYMMKCNQSFDIRQRSTLDSLVE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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