当前解析结果
SmilChr08G002753| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002753 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002753 |
| 描述 | MLO-like protein 4 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 27191380 - 27196011 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130997379 |
|---|---|
| GeneID | 130997379 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997379 |
| 原始查询 | LOC130997379 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | MLO-like protein 4 |
| 产物 | MLO-like protein 4 |
| Arabidopsis | AT1G11000 (MLO4)Seven transmembrane MLO family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837643] identity=69.1; qcov=0.949; evalue=0; confidence=high |
| Rice | Os11g0181400 (OsMLO11)- identity=61.6; qcov=0.97; evalue=0; confidence=high |
| GO | GO:0006952 (defense response); GO:0016020 (membrane) |
| KEGG | - |
| Pfam | PF03094 (Mlo) |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997379 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Cell membrane | 细胞膜 | 1.00000 | XP_057778651.1 |
| 2 | Vacuole | 液泡 | 0.20000 | XP_057778651.1 |
| 3 | Vacuole membrane | 液泡膜 | 0.20000 | XP_057778651.1 |
| 4 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057778651.1 |
| 5 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778651.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:27191933 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C73 |
Chr8:27192055 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 4 | B100,B17,B22,D1 |
Chr8:27192055 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B100,B17,B22,D1 |
Chr8:27192170 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B132,C43,C65 |
Chr8:27192355 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B123 |
Chr8:27193827 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B12 |
Chr8:27194139 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B132,B28 |
Chr8:27194756 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B107,B132,B28 |
Chr8:27194763 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B2 |
Chr8:27194763 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B2 |
Chr8:27194801 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B132,C43,C65 |
Chr8:27195473 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B120,C41,C84 |
结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
XP_057778651.1PF03094
Mlo 5-451 aa
| Protein ID | 来源 | 结构域编号 | 结构域名称 | 类型 | 起始 aa | 终止 aa | E-value | Score | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
XP_057778651.1 |
Pfam | PF03094 |
Mlo | Family | 5 | 451 | 7e-164 | 546.5 | Mlo family |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。