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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002762`

染色体: Chr08 坐标: 27244242-27246133 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002762`
名称	SmilChr08G002762
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 9-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27244242 - 27246133 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997386`
GeneID	`130997386`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997386`
原始查询	`LOC130997386`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 9-like
产物	heavy metal-associated isoprenylated plant protein 9-like
Arabidopsis	`AT3G04900` (AT3G04900) Heavy metal transport/detoxification superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819650] identity=30.8; qcov=0.399; evalue=1.43e-08; confidence=low
Rice	`Os01g0125600` (P0044F08.14) - identity=36.7; qcov=0.346; evalue=2.24e-07; confidence=low
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00403 (HMA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997386

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778657.1`
2	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057778657.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778657.1`
4	Cytoplasmic granule	细胞质颗粒	0.20000	`XP_057778657.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778657.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27244416`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:27244431`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B137,B25,B6,B66,B69,C67
`Chr8:27244575`	`A`	`AG`	1bp_insertion	frameshift_variant	37	A23,A8,B113,B128,B132,B140,B2,B20,B21,B3,B30,B36,B37,B49,B51,B61,B66,B69,B72,B79,B89,B90,B92,C21,C23,C27,C29,C30,C36,C40,C5,C58,C60,C65,C71,C76,C78
`Chr8:27244580`	`GGC`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	7	A3,B137,B25,B6,B69,C41,C67
`Chr8:27244630`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr8:27244639`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A4,B31,D9
`Chr8:27244650`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B41
`Chr8:27244663`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B16,B68,B81,C68
`Chr8:27244680`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A19,A23,B125,C21,C36
`Chr8:27244692`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	60	A23,A5,B101,B104,B108,B113,B119,B120,B127,B13,B132,B135,B139,B140,B17,B2,B20,B21,B3,B30,B35,B37,B48,B49,B5,B52,B61,B62,B63,B64,B66,B67,B69,B79,B89,B90,B92,B98,B99,C1,C18,C21,C22,C27,C29,C30,C36,C40,C43,C44,C5,C58,C59,C60,C65,C71,C76,C78,D10,D11
`Chr8:27244711`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A1,C8
`Chr8:27244765`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A21

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778657.1

228 aa

114

228

HMA

PF00403 HMA 13-62 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778657.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	13	62	2.9e-07	31.5	Heavy-metal-associated domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922674.1
GAGTTTCCTTATATACACCTGATGTGTATAAGCAGTTTCTTCAGAGAAAAATTCTACTATGAAATTTCAACCTACAATCTTGCGAGATATATAAGGAAAATTATTAAAAATTACTGAAAAATAGGGAAAGAAAAGAACCTTCCTTTTTGGTTTTATTTCTCTATATGAAAGATGAGATTTTGTTGTGCAGAGAGGACCGAATTTCATATTTCTTTCATCTTTTCCAATGGAAAATCACCTCCCTCATACAAGATTCCTTA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997386
ATGCAGGCCAAGGTTTTATCCATCAACATCAGTTGCTGTGAAAGATGCCCCAACCTTCTCAAGAAAAAAATTCTGAAAATGCCTGGGGTGGACTCAGTTGCAATAGATACAGAAGCCAACCTTGTATACGTCGCTGGCGAAATCGACGACGCGACGTTGTTGACCAACGTAGCGAAGCTAGGCAAACCAGTTCAACTTTTATCAACTGACAAGCAACCCAGGAACCATGCTGATAAGAAGAAACACAGCCACCACAGAAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778657.1
MQAKVLSINISCCERCPNLLKKKILKMPGVDSVAIDTEANLVYVAGEIDDATLLTNVAKLGKPVQLLSTDKQPRNHADKKKHSHHRNEGRDREFQKEKEHKNSCCCRDQRHNSQKRVEEKEEHRCEAYVPPAIDPKVCRDFFCKTHPKGRLIVDRVPPESSAAFFGMGDLPFHGPPYGGGSYQHPGAHGGYPGAHGGWYGQQPPQFGYGRPPPRRIPQHPFIFRGSHT

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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