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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002766`

染色体: Chr08 坐标: 27283046-27286113 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002766`
名称	SmilChr08G002766
描述	cationic amino acid transporter 7, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27283046 - 27286113 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997390`
GeneID	`130997390`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997390`
原始查询	`LOC130997390`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	cationic amino acid transporter 7, chloroplastic-like
产物	cationic amino acid transporter 7%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G10600` (CAT7) cationic amino acid transporter 7 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820229] identity=68.8; qcov=0.986; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0156866` (OsCAT9) - identity=67.7; qcov=0.943; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006865 (amino acid transport); GO:0015171 (amino acid transmembrane transporter activity); GO:0055085 (transmembrane transport)
KEGG	-
Pfam	PF00324 (AA_permease); PF13520 (AA_permease_2); PF13906 (AA_permease_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997390

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Vacuole	液泡	1.00000	`XP_057778661.1`
2	Vacuole membrane	液泡膜	1.00000	`XP_057778661.1`
3	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057778661.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778661.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778661.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27283260`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:27283275`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:27283591`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:27283599`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:27283827`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C65
`Chr8:27283953`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B109
`Chr8:27283953`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B109
`Chr8:27283955`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B109
`Chr8:27284039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D7
`Chr8:27284070`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B82
`Chr8:27284075`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A15,B49,C20,C44,C53
`Chr8:27284195`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778661.1

584 aa

292

584

AA_permease_2

AA_permease

AA_permease_C

PF13520 AA_permease_2 54-471 aa PF00324 AA_permease 62-452 aa PF13906 AA_permease_C 505-555 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778661.1`	Pfam	`PF13520`	AA_permease_2	Family	54	471	1.1e-49	170.3	Amino acid permease
`XP_057778661.1`	Pfam	`PF00324`	AA_permease	Domain	62	452	1.5e-26	93.9	Amino acid permease
`XP_057778661.1`	Pfam	`PF13906`	AA_permease_C	Domain	505	555	4.2e-13	49.9	C-terminus of AA_permease

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922678.1
GGAAACATGATTAAACTTTTTACATATGTGTGTTTGTCTCCGTGTATAAAAAGTGAGAATTGGGAGCCGCAATTGCGAAAGCATAGTTTGGGTTCCTCCCATAAACCAAGTGGGCGTTTGTTCTCGATTTCTTCATCGTATTTATTAGATATACATACAGACATTCTCACACCTAAACCCAGAAACATAGACTGACAATGGCAGCCCGCTCTTCCTCCTTCTCCACCTTCAAATCCTACCTCCACGCGCTCTCCGACACC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997390
ATGGCAGCCCGCTCTTCCTCCTTCTCCACCTTCAAATCCTACCTCCACGCGCTCTCCGACACCCCTCACCGCCTCCGCCGCCGCGCCTGCTCAGTCTCCACCTCATTAGAAGAAACTAACCGCTTGCGGGCCCGCTCCGGCTCCGAAATGAAGCGCACACTCGACTGGCGCGACCTCATCGGCTTCGGCGTCGGCGGCATGGTCGGCGCGGGCGTCTTCGTCACCACCGGCCGCGCCAGCCACTTCTGCGCCGGCCCCGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778661.1
MAARSSSFSTFKSYLHALSDTPHRLRRRACSVSTSLEETNRLRARSGSEMKRTLDWRDLIGFGVGGMVGAGVFVTTGRASHFCAGPAVILSYAIAGVCALLSAFCYTEFAVDMPVAGGSFSYIRVTFGEFPAFLTGANLIVDYVLSNAAVARGFTSYLGTALGLPANVQLRLAVHGLPKGYNEIDLIAVVVVLLITFVICYSTKESSWLNMSLTALHILFIAFVIAVGFWRGKLINFTEPGDPENAGGFFPFGASGVFNG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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