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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002783`

染色体: Chr08 坐标: 27516875-27519984 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002783`
名称	SmilChr08G002783
描述	nudix hydrolase 26, chloroplastic-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27516875 - 27519984 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997403`
GeneID	`130997403`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997403`
原始查询	`LOC130997403`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nudix hydrolase 26, chloroplastic-like
产物	nudix hydrolase 26%2C chloroplastic-like
Arabidopsis	`AT3G10620` (NUDX26) nudix hydrolase homolog 26 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820231] identity=74.5; qcov=0.793; evalue=7.01e-92; confidence=high
Rice	`Os04g0685800` - identity=65.6; qcov=0.803; evalue=2.31e-79; confidence=high
GO	GO:0006753 (nucleoside phosphate metabolic process); GO:0008893 (guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-diphosphatase activity); GO:0009507 (chloroplast); GO:0019693 (ribose phosphate metabolic process); GO:0034432 (bis(5'-adenosyl)-pentaphosphatase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00293 (NUDIX)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997403

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Chloroplast	叶绿体	1.00000	`XP_057778676.1`
2	Mitochondrion	线粒体	0.80000	`XP_057778677.1`
3	Mitochondrion matrix	线粒体基质	0.20000	`XP_057778677.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778676.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778676.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27517263`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59
`Chr8:27517266`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:27518058`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B26,C77
`Chr8:27519335`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B49
`Chr8:27519444`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778676.1

170 aa

170

NUDIX

PF00293 NUDIX 50-140 aa

XP_057778677.1

203 aa

102

203

NUDIX

PF00293 NUDIX 50-192 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778676.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	50	140	2.6e-17	63.8	NUDIX domain
`XP_057778677.1`	Pfam	`PF00293`	NUDIX	Domain	50	192	8.7e-22	78.3	NUDIX domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922694.1
TTTTTAGTTTTACCTTTGTTAATTGTTATACCGTCACGCACAACACTCTTCAGTCCGGCCGCCGTCGCCCCTGTCTCCGTCCCATCCAGGCTATTACCGTTAAACTTTATAAATATTTCTTGAATTAAGCCGTTGGCCTATGTGTGAGTTGTGAAATCGAAGAAATGTGGAATAGTTATGGTTGCTATTTCTTCAAGTTTACTTCACTTTAAAAATGTTTGTTTGATTGCTTTTGAATTGAATTTGAGAGAGTTGGAGCA...

XM_057922693.1
GGCTATTACCGTTAAACTTTATAAATATTTCTTGAATTAAGCCGTTGGCCTATGTGTGAGTTGTGAAATCGAAGAAATGTGGAATAGTTATGGTTGCTATTTCTTCAAGTTTACTTCACTTTAAAAATGTTTGTTTGATTGCTTTTGAATTGAATTTGAGAGAGTTGGAGCATTCGGGGCAGTCCAGACCCGATGTTAGGGTGTAAAGATGGGTCGGGTGGGAGTCTTGGCAGATTTTGGAGGCCGAAGCAAAACTCCGA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997403
ATGATGGCTTTATGCCGATCCCCATTTCAGCGTATAAACACACCTACACCTCTCTTCCATAACTGCCCCTCAAAGCTCCCCATATTTACACATCCATCTCCACTTTCTTCTCTCTCATCATCATCCATGGACACCCCACCCCAAGGTTACAGAAGAAATGTGGGGATTTGTCTTATCAACCCCTCCAAAAAGATTTTTGCTGCTTCAAGACTCGATATTCCAGATGCTTGGCAAATGCCTCAGGGTGGAATTGATGAAAG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778676.1
MMALCRSPFQRINTPTPLFHNCPSKLPIFTHPSPLSSLSSSSMDTPPQGYRRNVGICLINPSKKIFAASRLDIPDAWQMPQGGIDESEDPKNAAIRELREETGVTSADIVAEAPYWLTYDFPPEVRRKLMQQWGSDWKGQAQKWTRRSTSWAMERKRLSLDNGRGCPRRR

XP_057778677.1
MMALCRSPFQRINTPTPLFHNCPSKLPIFTHPSPLSSLSSSSMDTPPQGYRRNVGICLINPSKKIFAASRLDIPDAWQMPQGGIDESEDPKNAAIRELREETGVTSADIVAEAPYWLTYDFPPEVRRKLMQQWGSDWKGQAQKWFLLKFNGKDEEVNLLGDGTEKAEFGQWSWMSPQEVVDHAVDFKKPVYEQVMKAFSPYLE

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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