当前解析结果
SmilChr08G002786| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002786 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002786 |
| 描述 | basic leucine zipper 61 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 27547235 - 27551813 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997407 |
|---|---|
| GeneID | 130997407 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997407 |
| 原始查询 | LOC130997407 |
| 来源 | GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | basic leucine zipper 61 |
| 产物 | basic leucine zipper 61 |
| Arabidopsis | AT5G04840 (AT5G04840)bZIP protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:830363] identity=40.2; qcov=1.12; evalue=6.59e-60; confidence=medium |
| Rice | Os02g0538900 (OsbZIP21)- identity=34.2; qcov=1.17; evalue=2.24e-37; confidence=low |
| GO | GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0006355 (regulation of DNA-templated transcription) |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997407 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057778683.1 |
| 2 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057778683.1 |
| 3 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057778683.1 |
| 4 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057778683.1 |
| 5 | Telomere | 端粒 | 0.00000 | XP_057778683.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:27547479 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B134,B74,C2 |
Chr8:27548213 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | A23 |
Chr8:27548245 |
T |
TA |
1bp_insertion | frameshift_variant | 2 | B32,C61 |
Chr8:27548245 |
T |
TA |
1bp_insertion | CDS_variant | 2 | B32,C61 |
Chr8:27548249 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B134,B74,C2 |
Chr8:27550168 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr8:27550197 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr8:27550503 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr8:27550573 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr8:27550597 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | C16 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA2 records
下载 CDS FASTA2 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。