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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002791`

染色体: Chr08 坐标: 27601915-27605280 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002791`
名称	SmilChr08G002791
描述	uncharacterized SmilChr08G002791
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27601915 - 27605280 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997410`
GeneID	`130997410`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997410`
原始查询	`LOC130997410`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820349]; symbol=AT3G11760; hit=AT3G11760; species=arabidopsis; confidence=high
产物	structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820349]; symbol=AT3G11760; hit=AT3G11760; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G11760` (AT3G11760) structural maintenance of chromosomes flexible hinge domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820349] identity=49.5; qcov=1.03; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0649000` - identity=48; qcov=1.07; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF10358 (NT-C2); PF28979 (DUF8490)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997410

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778688.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	0.40000	`XP_057778688.1`
3	Cytoplasm	细胞质	0.20000	`XP_057778688.1`
4	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057778688.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778688.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27602106`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B13
`Chr8:27602151`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B1
`Chr8:27602151`	`AG`	`A`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B1
`Chr8:27602348`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:27602381`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B102,B107,C69
`Chr8:27602450`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C39,D2
`Chr8:27602526`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr8:27602538`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B2,B60
`Chr8:27602597`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B30,C39,C83
`Chr8:27602712`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:27602796`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D11
`Chr8:27602976`	`C`	`CAG`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	B110

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778688.1

705 aa

352

705

NT-C2

DUF8490

PF10358 NT-C2 38-149 aa PF28979 DUF8490 380-674 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778688.1`	Pfam	`PF10358`	NT-C2	Domain	38	149	2.7e-12	47.2	N-terminal C2 in EEIG1 and EHBP1 proteins
`XP_057778688.1`	Pfam	`PF28979`	DUF8490	Domain	380	674	1.9e-139	464.2	Domain of unknown function (DUF8490)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922705.1
AGTAGAGAGCCTTAATTTATAGTGGTGGCCATATGTTCGGCAGTCCACTCTCCCTCTCACAGCTGAAAAAGTAAACCAACGTTCAAATACTCTCACCATCAATTCTACTCTCATCATCAATTCTACTTTTAATAAAAAAAAGAAAAGGAAAAAAATTGATTTCATTCTATATATATTGCAGAGCCTCTCTCTCTCTCTCTCAAAGACAGAATTTGTTGGGTGGTACAGTTGATAAAAAAAAAAGTCAACAGAAAGGAGAG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997410
ATGGTGGTGAAGATGATGAAGTGGAGGCCGCGGCAATCGAAGAAATTGGAGGCGAGGATCACCGTTGATCATCTCAAAAGCGGCGTCGTAGGAGGTGGCGATTGCTCGAGATATTCGGTTGAGATCAAATGGAAAGGCGCGAAAGGGATCTCCTTGAGCTCTTTGAGGAAGAGTGTGAGAAGGAATTTCACCAAGGAGATGTCGCTGAACCAAGACGGAGTCGCTCGATTCGACGAAGAATTTCGATGTTTCTGCGCTTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778688.1
MVVKMMKWRPRQSKKLEARITVDHLKSGVVGGGDCSRYSVEIKWKGAKGISLSSLRKSVRRNFTKEMSLNQDGVARFDEEFRCFCALSANKDGLFHPWEVSFTVFNGSNSVGTASLNLADFDKQGRDIDIPLLIINASLHLSIHLVELRNVQDQAEAAPKPILLFPRSPCYGEMFSTEKQDLKANSSPIRVNIFKGLSALRPKRAGQEDDGGSSERSEGGVYPLDSSDSDGHASGEGLSEEDSGDRKSFSYGTLAYANHA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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