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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002793`

染色体: Chr08 坐标: 27636692-27640585 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002793`
名称	SmilChr08G002793
描述	uncharacterized SmilChr08G002793
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27636692 - 27640585 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997412`
GeneID	`130997412`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997412`
原始查询	`LOC130997412`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Mitochondrial glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008179]; symbol=AT4G32605; hit=AT4G32605; species=arabidopsis; confidence=high
产物	Mitochondrial glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008179]; symbol=AT4G32605; hit=AT4G32605; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT4G32605` (AT4G32605) Mitochondrial glycoprotein family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:5008179] identity=58.1; qcov=0.805; evalue=2.25e-80; confidence=high
Rice	`Os01g0771100` - identity=54.6; qcov=0.805; evalue=5.98e-71; confidence=high
GO	GO:0005759 (mitochondrial matrix)
KEGG	-
Pfam	PF02330 (MAM33)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997412

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Mitochondrion	线粒体	1.00000	`XP_057778691.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778691.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778691.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778691.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778691.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27637024`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C4
`Chr8:27638918`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B114
`Chr8:27640223`	`TA`	`*`	1bp_deletion	CDS_variant	2	B66,B8
`Chr8:27640253`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C4
`Chr8:27640290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	1	B106
`Chr8:27640290`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B106
`Chr8:27640392`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C45
`Chr8:27640401`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B59

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778691.1

282 aa

141

282

MAM33

PF02330 MAM33 167-272 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778691.1`	Pfam	`PF02330`	MAM33	Domain	167	272	2.8e-19	70.6	Mitochondrial glycoprotein

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922708.1
ATAAAAAAATCATCAAGATAAATACGAGTTGAAGTGGATCTCGAAGTGGAGCTTATTACTTTAATCGAATAATCAAACTGAACTCGAATTAAACTTAAGCTTAATGGAGTATTTCGAGCTGAAGCTCAATTTAATGGTGGAATGCAAACTCGTCGAATAATCATTTCACGATTCGTAGAGAGCCCTACTTTGAGTCATATATACGCCGTCGAAACTCGAAACCTTAAACCTCTTGCAGGATTTAAAGCAGCTGAGCATTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997412
ATGCAAACTCGTCGAATAATCATTTCACGATTCGTAGAGAGCCCTACTTTGAGTCATATATACGCCGTCGAAACTCGAAACCTTAAACCTCTTGCAGGATTTAAAGCAGCTGAGCATTCGAGAGAAACAACAAAACCTCGAAACGCGATGACGTGGAGGAGGGCTCTATTGTGCGCGGGTGGCGTCGCGCACCAACTACTGACACAGCCCTCGCGCACGATAGCTTCGCGGCCGTTTTCGTCGACGGCGTCGTACACCGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778691.1
MQTRRIIISRFVESPTLSHIYAVETRNLKPLAGFKAAEHSRETTKPRNAMTWRRALLCAGGVAHQLLTQPSRTIASRPFSSTASYTVNSVILRSLKDHYIEVTKMTPPPKISPPSPYEVVKGALNNGGPVLRRMFNDEVINVSVMRMVDIVPGGSADDYGGDNINQLFVHVDISKPGQQESLHFLCGMYPDALGIHSVSMRPKADSGGFLVVPSKYNGPVFEDVNEKIRDALHSYIEERGINESLFPFLQAWLYVKDHRN...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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