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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002794`

染色体: Chr08 坐标: 27648616-27657494 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002794`
名称	SmilChr08G002794
描述	nuclear pore complex protein NUP1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27648616 - 27657494 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997413`
GeneID	`130997413`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997413`
原始查询	`LOC130997413`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear pore complex protein NUP1
产物	nuclear pore complex protein NUP1
Arabidopsis	`AT3G10650` (NUP1) nuclear pore complex protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:820234] identity=38.4; qcov=0.478; evalue=1.28e-74; confidence=medium
Rice	`Os03g0788300` - identity=28.4; qcov=0.281; evalue=1.49e-17; confidence=weak
GO	GO:0005635 (nuclear envelope); GO:0016973 (poly(A)+ mRNA export from nucleus); GO:0071763 (nuclear membrane organization)
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997413

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778692.1`
2	Nuclear pore complex	核孔复合体	1.00000	`XP_057778692.1`
3	Nucleus membrane	核膜	1.00000	`XP_057778692.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778692.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778692.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27649017`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C4
`Chr8:27649091`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B15,C15,D6
`Chr8:27649104`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C45
`Chr8:27649127`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B77,C19
`Chr8:27649128`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C4
`Chr8:27649180`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B10
`Chr8:27649280`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:27649420`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B107,C11,C69
`Chr8:27649670`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B108
`Chr8:27649782`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C84
`Chr8:27649924`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B10,B69
`Chr8:27650172`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C22,C4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

7 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922710.1
AATAAAGCTAGCACGAGCCGCATAAACTCACGCTTGCTTCCTGAAGGAATTTCATACGCATTTAATTATTCGGTGCCCATTATTTTTCTTTTTCGTTTTGTTTTTTATTATCGAGCATCGCTTTCTCTGGCTACTCCCCAAAATAAAACCCTAGCTTTCGCCCCTAACACCTAAATTTCAAAATCGGACGAGAATGTCGACAGCGGAAGAAGGCGAAGCAGCCGCTAACGCCACCACATCTTCGTACGGTGGGGGAGGAG...

XM_057922713.1
CTTCCTGAAGGAATTTCATACGCATTTAATTATTCGGTGCCCATTATTTTTCTTTTTCGTTTTGTTTTTTATTATCGAGCATCGCTTTCTCTGGCTACTCCCCAAAATAAAACCCTAGCTTTCGCCCCTAACACCTAAATTTCAAAATCGGACGAGAATGTCGACAGCGGAAGAAGGCGAAGCAGCCGCTAACGCCACCACATCTTCGTACGGTGGGGGAGGAGCCGGAGGGAAGTTCCGGAAGAAGCCTTTTCGCCAAC...

CDS

7 records

下载 CDS FASTA

LOC130997413
ATGTCGACAGCGGAAGAAGGCGAAGCAGCCGCTAACGCCACCACATCTTCGTACGGTGGGGGAGGAGCCGGAGGGAAGTTCCGGAAGAAGCCTTTTCGCCAACAGGCGACTCCTTACGACCGACCCCCCACCGCCCTTCGTGGTAACAACACTAATAGCGACGATAGTAGCAGCTGGTGGACGAAGCTATTGGAGCCCGCCTCTAAGGCCATATCATATGGCGCGGACCGCTTCTTCGGTTCTGTCTTTCGTAGGCGCCT...

Protein

7 records

下载 Protein FASTA

XP_057778692.1
MSTAEEGEAAANATTSSYGGGGAGGKFRKKPFRQQATPYDRPPTALRGNNTNSDDSSSWWTKLLEPASKAISYGADRFFGSVFRRRLPPPPPPQPPAESNVQESGGDQGTGFNSQRGEQEPKSGQCSQPINSSSSNGVTELEHLLKQKTFTRAEIAHLAELLQSRAAEVSPGDASRINVVSALDSGRQKEFASGISEGNINDGIRSSALMLTPIHNSKVLENDIASPAELAKAYMGSRPSQVSPSLLGLRNQLGKEGTGL...

XP_057778693.1
MSTAEEGEAAANATTSSYGGGGAGGKFRKKPFRQQATPYDRPPTALRGNNTNSDDSSSWWTKLLEPASKAISYGADRFFGSVFRRRLPPPPPPQPPESNVQESGGDQGTGFNSQRGEQEPKSGQCSQPINSSSSNGVTELEHLLKQKTFTRAEIAHLAELLQSRAAEVSPGDASRINVVSALDSGRQKEFASGISEGNINDGIRSSALMLTPIHNSKVLENDIASPAELAKAYMGSRPSQVSPSLLGLRNQLGKEGTGLL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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