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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002835`

染色体: Chr08 坐标: 28231050-28234285 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002835`
名称	SmilChr08G002835
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28231050 - 28234285 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997429`
GeneID	`130997429`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997429`
原始查询	`LOC130997429`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase-like
Arabidopsis	`AT3G55430` (AT3G55430) O-Glycosyl hydrolases family 17 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824709] identity=54.2; qcov=0.976; evalue=1.25e-168; confidence=high
Rice	`Os11g0704600` - identity=50.7; qcov=0.973; evalue=1.51e-155; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17); PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997429

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	0.80000	`XP_057778727.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.80000	`XP_057778727.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778727.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778727.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778727.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28231462`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:28232541`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:28232543`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:28232595`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B123
`Chr8:28232685`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A23,B26,B73,C77
`Chr8:28232727`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B117,B123,C14,C25
`Chr8:28232848`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C18
`Chr8:28232848`	`TAC`	`T`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C18
`Chr8:28233723`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B61
`Chr8:28233723`	`GC`	`G`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B61
`Chr8:28233734`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A8
`Chr8:28233755`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	A19

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778727.1

453 aa

226

453

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 26-340 aa PF07983 X8 367-437 aa

XP_057778728.1

452 aa

226

452

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 26-340 aa PF07983 X8 366-436 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778727.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	26	340	7.1e-74	249.9	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057778727.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	367	437	6.3e-22	78.7	X8 domain
`XP_057778728.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	26	340	7.1e-74	249.9	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057778728.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	366	436	6.3e-22	78.7	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922744.1
GTTTGGTTGGTTGGTGTCGATCGTAAAATAAACAAAAAATAAGAATAAGCATCATCACACAATTACCATAAATTTCTCTCAAATTCTCCACTCTCCATTTCCCTATATAAACCCCAAGTGATGTCGCTGTGGATGACAAGATAAATAATTTAACGAAAAATGGTGGTCACTTGTAATTACGCCGCCGCGGCCCTGGCCGTCGTCCTCCTGGCCGCGGCGGGCGGCGTGGAGTCGATCGGCGTGAACTACGGCACCCTGGG...

XM_057922745.1
AAATTTCTCTCAAATTCTCCACTCTCCATTTCCCTATATAAACCCCAAGTGATGTCGCTGTGGATGACAAGATAAATAATTTAACGAAAAATGGTGGTCACTTGTAATTACGCCGCCGCGGCCCTGGCCGTCGTCCTCCTGGCCGCGGCGGGCGGCGTGGAGTCGATCGGCGTGAACTACGGCACCCTGGGCGACAACCTCCCCCCGGCGAGGCAGGTGGTGCAGTTCCTGAAGGAGAAAACGAGCATCGACCGCGTGAA...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997429
ATGGTGGTCACTTGTAATTACGCCGCCGCGGCCCTGGCCGTCGTCCTCCTGGCCGCGGCGGGCGGCGTGGAGTCGATCGGCGTGAACTACGGCACCCTGGGCGACAACCTCCCCCCGGCGAGGCAGGTGGTGCAGTTCCTGAAGGAGAAAACGAGCATCGACCGCGTGAAGATCTTCGATGCAAACCCCGACATCCTCGGCGCCTTCGCCAACAGCGGCATCTTGGTGGCCGTGACGGTCCCCAACGACCAAATCCCGGC...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778727.1
MVVTCNYAAAALAVVLLAAAGGVESIGVNYGTLGDNLPPARQVVQFLKEKTSIDRVKIFDANPDILGAFANSGILVAVTVPNDQIPALTTAKAARRWVSAHIKPFYPDTHINYILVGNEVLHWGPQSLIDNLVAAMRSLHKALHHEGINDVAVTTAHSLAILQPSDLPSLASFRPGWDVGVLAPMLEFHRQTRTPFMVNPYPYFMYSPEKADMALFRPNKGLFDRYTRRTYGNLFDFLMDSVYMAMKKMGYGDVAIAVGE...

XP_057778728.1
MVVTCNYAAAALAVVLLAAAGGVESIGVNYGTLGDNLPPARQVVQFLKEKTSIDRVKIFDANPDILGAFANSGILVAVTVPNDQIPALTTAKAARRWVSAHIKPFYPDTHINYILVGNEVLHWGPQSLIDNLVAAMRSLHKALHHEGINDVAVTTAHSLAILQPSDLPSLASFRPGWDVGVLAPMLEFHRQTRTPFMVNPYPYFMYSPEKADMALFRPNKGLFDRYTRRTYGNLFDFLMDSVYMAMKKMGYGDVAIAVGE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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