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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002838`

染色体: Chr08 坐标: 28254498-28257881 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002838`
名称	SmilChr08G002838
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28254498 - 28257881 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997430`
GeneID	`130997430`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997430`
原始查询	`LOC130997430`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	glucan endo-1,3-beta-glucosidase-like
产物	glucan endo-1%2C3-beta-glucosidase-like
Arabidopsis	`AT3G55430` (AT3G55430) O-Glycosyl hydrolases family 17 protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824709] identity=55.2; qcov=0.982; evalue=4.12e-174; confidence=high
Rice	`Os11g0704600` - identity=49.3; qcov=0.978; evalue=9.34e-153; confidence=high
GO	GO:0004553 (hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0005975 (carbohydrate metabolic process)
KEGG	-
Pfam	PF00332 (Glyco_hydro_17); PF07983 (X8)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997430

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell wall	细胞壁	1.00000	`XP_057778730.1`
2	Secreted	分泌到胞外	0.60000	`XP_057778730.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778730.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778730.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778730.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28255399`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B51,C35,C39
`Chr8:28255576`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A9,B26,B73,C77
`Chr8:28256721`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:28256736`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B12,B133,B51,C10
`Chr8:28256760`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	5	B12,B133,B18,B51,C10
`Chr8:28256760`	`GCA`	`G`	2bp_deletion	CDS_variant	5	B12,B133,B18,B51,C10
`Chr8:28256764`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	5	B12,B133,B18,B51,C10
`Chr8:28256764`	`G`	`GGT`	2bp_insertion	CDS_variant	5	B12,B133,B18,B51,C10
`Chr8:28256811`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:28256844`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A22,C48
`Chr8:28256849`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	frameshift_variant	1	C12
`Chr8:28256849`	`G`	`GTT`	2bp_insertion	CDS_variant	1	C12

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778730.1

452 aa

226

452

Glyco_hydro_17

PF00332 Glyco_hydro_17 21-337 aa PF07983 X8 366-436 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778730.1`	Pfam	`PF00332`	Glyco_hydro_17	Domain	21	337	1.8e-70	238.7	Glycosyl hydrolases family 17
`XP_057778730.1`	Pfam	`PF07983`	X8	Domain	366	436	2.4e-20	73.6	X8 domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093078.1
TTTAGGCAAGAAATGAATCAGCACCGCCACCACACAAAATTCATCACATAAATTCCCAAATTTCAGGCAAATCTCCCACTTCTCCATCATATTACATATTTACATATTTAATCATTCCTTCCTCCACACAAACAACACACATTCCTCCTCAAAAAAAATGCCCGTCGTTCTTCTTCAGTACATCCTCCTCCTGGCCACGGCCGCCGCCGTGGAGTCGATCGGCGTGAACTACGGCACCCTGGGCGACAACCTCCCCCCGC...

XM_057922747.1
GTAGAATTTAGGCAAGAAATGAATCAGCACCGCCACCACACAAAATTCATCACATAAATTCCCAAATTTCAGGCAAATCTCCCACTTCTCCATCATATTACATATTTACATATTTAATCATTCCTTCCTCCACACAAACAACACACATTCCTCCTCAAAAAAAATGCCCGTCGTTCTTCTTCAGTACATCCTCCTCCTGGCCACGGCCGCCGCCGTGGAGTCGATCGGCGTGAACTACGGCACCCTGGGCGACAACCTCC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997430
ATGCCCGTCGTTCTTCTTCAGTACATCCTCCTCCTGGCCACGGCCGCCGCCGTGGAGTCGATCGGCGTGAACTACGGCACCCTGGGCGACAACCTCCCCCCGCCGGCCCAGGTGGCGCAGTTCCTGAAGGAGAAGACGAGCATCGACCGCGTGAAGATCTTCGACGCGAACCCCGACATCCTCCGCGCCTTCGCCAACACCGGCATCCTGGTCGCCATCACCGTCCCCAACGGCGAAATCCCCGCGGTGGCTGACCCGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778730.1
MPVVLLQYILLLATAAAVESIGVNYGTLGDNLPPPAQVAQFLKEKTSIDRVKIFDANPDILRAFANTGILVAITVPNGEIPAVADPKEARRWVSEHIKPFYPDTHINYLIVGNEVLHWGPQNLIDNLVGAMRSLHNALQQEGMSDIAVTTAHSLAILEPSDTPSLARFRPGWDVGVIAPILAFHRETKTPFMVNPYPYFTYTPEKYDINMAVFRPNKGLRDRYTRRSYGNLFDFLLDSVYMAMKRLRLDDVEIVVGETGW...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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