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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002812`

染色体: Chr08 坐标: 27968980-27970221 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002812`
名称	SmilChr08G002812
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 19-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	27968980 - 27970221 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997438`
GeneID	`130997438`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997438`
原始查询	`LOC130997438`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	AT-hook motif nuclear-localized protein 19-like
产物	AT-hook motif nuclear-localized protein 19-like
Arabidopsis	`AT4G14465` (AHL20) AT-hook motif nuclear-localized protein 20 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:827093] identity=56.8; qcov=1.05; evalue=3.75e-84; confidence=high
Rice	`Os08g0563200` - identity=68.9; qcov=0.71; evalue=1.16e-77; confidence=high
GO	GO:0003680 (minor groove of adenine-thymine-rich DNA binding); GO:0003700 (DNA-binding transcription factor activity); GO:0005634 (nucleus)
KEGG	-
Pfam	PF03479 (PCC)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997438

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778746.1`
2	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778746.1`
3	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778746.1`
4	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778746.1`
5	Telomere	端粒	0.00000	`XP_057778746.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:27969164`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	C21,C24,C36,C59
`Chr8:27969251`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C77
`Chr8:27969302`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B11,B37,B42,B43,B97
`Chr8:27969382`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C52
`Chr8:27969443`	`TC`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	D3
`Chr8:27969443`	`TC`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	D3
`Chr8:27969515`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C87
`Chr8:27969704`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B111,B50,C29
`Chr8:27969884`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B130,B77,C19,D6
`Chr8:27969888`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778746.1

276 aa

138

276

PCC

PF03479 PCC 91-208 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778746.1`	Pfam	`PF03479`	PCC	Domain	91	208	1.4e-33	116.2	Plants and Prokaryotes Conserved (PCC) domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922763.1
CATCTTATTATATACATATCCCTTTGCAAGTCAGTGTCAGAAAACACAGACGACAGCGACAAAGAAAAAGACAGCTAAACGAATACTTTGACGCATTCTCACCAAATAGATTAACAAATTAAACCCCTATTATTGTTTGATCTTTAATTTAATTATTCACTCTTCAAGCTCACCTTAACCCCTTTTTCCCCTTTCATATTTCTTTATCACACTCCAACCTTATCTTCTCCGATCAAATTAGGGTTTCTTAATTTTGCTAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997438
ATGACGAACCGGTGGTGGGCGGCCGCGGGAGTCGACTCGTCGTCGCCGGCGCCGGCGATCGGGAAATCCGATCTCGTGAGCGAGAGCATGGCGATGAAGAATCCGGATCTGAGCATAGCAATGAACGACGGCGTCGGGGGCGGGGGCGGGGGCGGGGGTGAGGAAGAGGAGGAGGAGAGGGAGGGGGCGGTGGAGGCGCCGGCGCGGCGCCCGAGGGGGAGGCCGTCGGGCTCGAAGAACAAGCCGAAGCCGCCGATCTT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778746.1
MTNRWWAAAGVDSSSPAPAIGKSDLVSESMAMKNPDLSIAMNDGVGGGGGGGGEEEEEEREGAVEAPARRPRGRPSGSKNKPKPPIFVTRDSPNALRSHVLEVASGSDVAESIAQFARRRQRGVCVLSANGTVANVTIRQPSAAAGAVALHGRFEILSLTGSFLPGPSPPGSTGLTVYLAGGQGQVLGGSVIGALVAAGPVMVIASTFSNAVYERLPLEEEEEEAGGGGDMGGGVEQGGMGDLSGYNNMAAASLLHNGGH...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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