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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003870`

染色体: Chr01 坐标: 56951655-56955578 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003870`
名称	SmilChr01G003870
描述	protein THALLO
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56951655 - 56955578 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997459`
GeneID	`130997459`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997459`
原始查询	`LOC130997459`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein THALLO
产物	protein THALLO
Arabidopsis	`AT2G43650` (EMB2777) Sas10/U3 ribonucleoprotein (Utp) family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818967] identity=45.4; qcov=0.997; evalue=1.37e-74; confidence=high
Rice	`Os01g0104800` - identity=36.5; qcov=0.816; evalue=9.06e-44; confidence=medium
GO	GO:0000462 (maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)); GO:0005730 (nucleolus); GO:0032040 (small-subunit processome)
KEGG	-
Pfam	PF04000 (Sas10_Utp3)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997459

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778757.1`
2	Nucleolus	核仁	1.00000	`XP_057778757.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778757.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778757.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778757.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56951985`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	119	A10,A13,A14,A18,A19,A3,A5,A6,B1,B10,B101,B102,B103,B105,B107,B108,B11,B113,B117,B118,B119,B120,B122,B123,B124,B126,B129,B131,B133,B134,B137,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B21,B24,B28,B29,B31,B32,B34,B37,B38,B39,B4,B40,B44,B46,B50,B53,B54,B55,B57,B59,B61,B65,B66,B70,B71,B79,B8,B81,B87,B88,B89,B9,B93,B94,B95,B97,C1,C11,C12,C13,C14,C15,C17,C20,C30,C35,C36,C37,C38,C39,C40,C41,C43,C47,C51,C52,C53,C57,C58,C59,C6,C60,C63,C64,C65,C66,C67,C69,C75,C76,C78,C79,C8,C81,C82,C83,D1,D10,D11,D3,D4,D9
`Chr1:56952288`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr1:56952289`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B37
`Chr1:56952813`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B137
`Chr1:56953574`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C44
`Chr1:56953593`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	2	B16,B24
`Chr1:56953593`	`T`	`TA`	1bp_insertion	CDS_variant	2	B16,B24
`Chr1:56953622`	`T`	`TA`	1bp_insertion	frameshift_variant	6	B108,B117,B140,B57,B93,C75
`Chr1:56953629`	`T`	`TG`	1bp_insertion	frameshift_variant	1	B12
`Chr1:56953629`	`T`	`TG`	1bp_insertion	CDS_variant	1	B12
`Chr1:56953760`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B85,C61
`Chr1:56953940`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B114,B85,C56

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778757.1

369 aa

184

369

Sas10_Utp3

PF04000 Sas10_Utp3 247-327 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778757.1`	Pfam	`PF04000`	Sas10_Utp3	Family	247	327	3.8e-15	56.9	Sas10/Utp3/C1D family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922774.1
TTTGCATATTAACCCATATTTTTCCGCCGGCTTTTTCCCGCCACCGCTCTGCTTCTCTCTCCGAAGACGCCTACATCTGCTCAACGCTTCGCCACTGTTTCAGATAGATTTTAGGTTTGCGCAGTGGGAGGAAGAATCATGGGGAAAAAATTAAAAGCCGGGAAGTTCAAGAAGAAGGAAGATAATGGCCGTCCGAAGAAAAATTCAATTCGATTTGATTCTGATAATGAAGACATGATGGACGACGATATTGATGTTTT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997459
ATGGGGAAAAAATTAAAAGCCGGGAAGTTCAAGAAGAAGGAAGATAATGGCCGTCCGAAGAAAAATTCAATTCGATTTGATTCTGATAATGAAGACATGATGGACGACGATATTGATGTTTTTCATAAGAAAAGGAACGTTATACCACTGAACATAAACGAGGATGTGGAAGAATCTGACGAGGATGCCGAGCAGCCTGTGCTAGATTTTGAGGATGAGGATGAGGATGAGGAAGATGAAGACACTGATGATGATGATGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778757.1
MGKKLKAGKFKKKEDNGRPKKNSIRFDSDNEDMMDDDIDVFHKKRNVIPLNINEDVEESDEDAEQPVLDFEDEDEDEEDEDTDDDDDKPPKGLAVKIARTQKYLRAKFGDAEDEILDDADEEEPGRDFWGKKSDLYGADVGNEPQSSDDKDAAEEEDAVLKRQMTIANNLSMEDYGLERSFVDSSSFVTFQEILDHGKPPSKSSLDKXIKDEEGMTYEIVKKDLNALTKEEQMDVVYSSAPELIGLLSELKDALEQLENK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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