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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002851`

染色体: Chr08 坐标: 28353625-28356298 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002851`
名称	SmilChr08G002851
描述	uncharacterized SmilChr08G002851
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28353625 - 28356298 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997465`
GeneID	`130997465`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997465`
原始查询	`LOC130997465`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819726]; symbol=AT3G05600; hit=AT3G05600; species=arabidopsis; confidence=high
产物	alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819726]; symbol=AT3G05600; hit=AT3G05600; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT3G05600` (AT3G05600) alpha/beta-Hydrolases superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:819726] identity=61.1; qcov=1.02; evalue=7.93e-157; confidence=high
Rice	`Os05g0273800` - identity=55.8; qcov=1; evalue=7.17e-136; confidence=high
GO	GO:0016787 (hydrolase activity)
KEGG	-
Pfam	PF00561 (Abhydrolase_1); PF12146 (Hydrolase_4); PF12697 (Abhydrolase_6)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997465

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778760.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778760.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778760.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778760.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778760.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28353835`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C17
`Chr8:28353843`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	11	A5,B115,B124,B138,B5,C26,C36,C43,C45,C53,C70
`Chr8:28353847`	`G`	`GA`	1bp_insertion	frameshift_variant	10	A20,B44,B64,B95,C10,C24,C45,C47,C58,C86
`Chr8:28353853`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B53
`Chr8:28353900`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B122,C74
`Chr8:28353923`	`ACC`	`A`	2bp_deletion	frameshift_variant	9	B100,B113,B130,B135,B24,B34,B44,C20,C52
`Chr8:28353968`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	7	A2,B105,B112,B71,C46,C69,D8
`Chr8:28353981`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A6,B126,C12
`Chr8:28353982`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B36,C31,C73,D11
`Chr8:28353983`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A21,B29,D9
`Chr8:28353985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:28353987`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A16,B110,B65,C39,C79

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778760.1

318 aa

159

318

Abhydrolase_1

Hydrolase_4

Abhydrolase_6

PF00561 Abhydrolase_1 25-300 aa PF12146 Hydrolase_4 26-140 aa PF12697 Abhydrolase_6 27-306 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778760.1`	Pfam	`PF00561`	Abhydrolase_1	Domain	25	300	1.3e-27	97.7	alpha/beta hydrolase fold
`XP_057778760.1`	Pfam	`PF12146`	Hydrolase_4	Domain	26	140	2.4e-11	44.2	Serine aminopeptidase, S33
`XP_057778760.1`	Pfam	`PF12697`	Abhydrolase_6	Domain	27	306	2.5e-21	78.0	Alpha/beta hydrolase family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922777.1
ATTCCTAAAAAGAGGCTTTATTTTAATGGGATGATATATTTAAATAAATAGACCTCATCTAAAGTCGCTATGCTTAACTTGCATTTATAGAAACGCTCACACACAGAGAGAGGAGAGAGAGAGAGAGATGGAGGGGATTGAGCACAGAAGAGTGAGCGTAAACGGCATAAACATGCACGTAGCGGAGAAAGGGGAAGGCCCCACGGTGCTTCTCCTCCACGGCTTTCCCGAGCTCTGGTACACGTGGCGCCACCAGATTG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997465
ATGGAGGGGATTGAGCACAGAAGAGTGAGCGTAAACGGCATAAACATGCACGTAGCGGAGAAAGGGGAAGGCCCCACGGTGCTTCTCCTCCACGGCTTTCCCGAGCTCTGGTACACGTGGCGCCACCAGATTGTGGCGCTGGCCGCCCTCGGATACCGCGCCGTCGCCCCCGATCTCCGCGGCTTCGGCGACACGGACGCGCCGCCCCACGCGTCCAGCTACTCCTGCCTCCACGTCGCCGGCGATATCGTAGCCCTCAT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778760.1
MEGIEHRRVSVNGINMHVAEKGEGPTVLLLHGFPELWYTWRHQIVALAALGYRAVAPDLRGFGDTDAPPHASSYSCLHVAGDIVALIESLGGQPVFLVAHDWGAMVAWYLCQFRPDLVKAFVSLTVPFRPRHPTVKPIAAMRAFFGDEYYMCRFQEVGKVESEMAEYGAEAVIKKILSDRTPGPTRMPKEKPFGADPKSIKLPQWFTEEDLKYYADKYEQKGFTGGLNYYRALDLNWELTAAWTAAKVRVPVKFMVGDLD...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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