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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr01G003874`

染色体: Chr01 坐标: 56991889-56997769 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr01G003874`
名称	SmilChr01G003874
描述	vesicle transport protein GOT1
染色体 / SeqID	Chr01 / NC_080387.1
坐标与链方向	56991889 - 56997769 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997498`
GeneID	`130997498`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997498`
原始查询	`LOC130997498`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	vesicle transport protein GOT1
产物	vesicle transport protein GOT1
Arabidopsis	`AT1G05785` (AT1G05785) Got1/Sft2-like vescicle transport protein family [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837087] identity=63.7; qcov=1; evalue=1.62e-61; confidence=high
Rice	`Os02g0602800` - identity=67.7; qcov=0.985; evalue=1.56e-54; confidence=high
GO	GO:0006888 (endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport); GO:0042147 (retrograde transport, endosome to Golgi)
KEGG	-
Pfam	PF04178 (Got1)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997498

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Golgi apparatus	高尔基体	0.80000	`XP_057778810.1`
2	Trans-golgi network	Trans-golgi network	0.40000	`XP_057778810.1`
3	Endoplasmic reticulum	内质网	0.20000	`XP_057778810.1`
4	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	0.20000	`XP_057778810.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778810.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr1:56994672`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B17,B62,B81,C12,C56
`Chr1:56994861`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C16
`Chr1:56994891`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C5
`Chr1:56994915`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778810.1

135 aa

135

Got1

PF04178 Got1 15-114 aa

XP_057778820.1

135 aa

135

Got1

PF04178 Got1 15-114 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778810.1`	Pfam	`PF04178`	Got1	Family	15	114	5.5e-11	43.7	Got1/Sft2-like family
`XP_057778820.1`	Pfam	`PF04178`	Got1	Family	15	114	5.5e-11	43.7	Got1/Sft2-like family

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

6 records

下载 cDNA FASTA

XR_009093113.1
ATAACACCCCCCCACCCCAAAAAAAGAATCATTTTCTACATTTAAAAAAAGAGTTCGTTCTTTCGTAAAAGCAAAAGAAGAGTTCATTTTCGTTGATAAAAGTTCAAAGAATTGAAGAAGTTCTCCCAAAACCTATCACTGTCAGTATCACACTCACAATTTCACATCATAATTTGTTGTAGTCCTATGCAAGTCGATTAACTGTCAACATATCCTTTCGCTTTGATTACAAAAGGCGAAATCCACGCCCAATCGCAGCC...

XR_009093110.1
ATAACACCCCCCCACCCCAAAAAAAGAATCATTTTCTACATTTAAAAAAAGAGTTCGTTCTTTCGTAAAAGCAAAAGAAGAGTTCATTTTCGTTGATAAAAGTTCAAAGAATTGAAGAAGTTCTCCCAAAACCTATCACTGTCAGTATCACACTCACAATTTCACATCATAATTTGTTGTAGTCCTATGCAAGTCGATTAACTGTCAACATATCCTTTCGCTTTGATTACAAAAGGCGAAATCCACGCCCAATCGCAGCC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997498
ATGCCGTATGAATTGAGCGAACAGAAAAAGGTTGGTCTTGGTCTGATTGGGTTTGGTATATTCTTCACGTTTCTTGCTGTGATTCTATTTTTCGACAGAGGTTTGCTAGCTCTTGGAAATATCTTTTGGCTGACAGGTGTAGCCATTTTACTAGGCTGGCGATCAACATTGCAACTCTTCACAGACCGGAGGAATTATAAGGGTTCAGTTTCCTTTCTTCTCGGGATATTCTTTATATTTGTCCGTTGGCCTGTAGTTGG...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778810.1
MPYELSEQKKVGLGLIGFGIFFTFLAVILFFDRGLLALGNIFWLTGVAILLGWRSTLQLFTDRRNYKGSVSFLLGIFFIFVRWPVVGILVEIYGCIVLFSGFWPSIKAFLYQIPVIGWILQYPALLINQFTKSSR

XP_057778820.1
MPYELSEQKKVGLGLIGFGIFFTFLAVILFFDRGLLALGNIFWLTGVAILLGWRSTLQLFTDRRNYKGSVSFLLGIFFIFVRWPVVGILVEIYGCIVLFSGFWPSIKAFLYQIPVIGWILQYPALLINQFTKSSR

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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