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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002895`

染色体: Chr08 坐标: 28839458-28849566 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002895`
名称	SmilChr08G002895
描述	protein SEMI-ROLLED LEAF 2
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	28839458 - 28849566 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997501`
GeneID	`130997501`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997501`
原始查询	`LOC130997501`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SEMI-ROLLED LEAF 2
产物	protein SEMI-ROLLED LEAF 2
Arabidopsis	`AT5G26850` (AT5G26850) Uncharacterized protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:832743] identity=54.6; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0308200` (NRL2) - identity=48.1; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF21052 (EFR3_ARM)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997501

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057778809.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.60000	`XP_057778809.1`
3	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778809.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778809.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778809.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:28840226`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B134
`Chr8:28841221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B79,C45
`Chr8:28841225`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B71,C78,C80
`Chr8:28844021`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	10	B112,B3,B31,B45,C3,C44,C57,C63,C67,C86
`Chr8:28844205`	`CT`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B72
`Chr8:28844205`	`CT`	`C`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B72
`Chr8:28845113`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:28845157`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B139,B73,B85,C24,C75
`Chr8:28845164`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B1
`Chr8:28846059`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:28846499`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B76
`Chr8:28846521`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,D2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778809.1

986 aa

493

986

EFR3_ARM

PF21052 EFR3_ARM 54-758 aa

XP_057778811.1

986 aa

493

986

EFR3_ARM

PF21052 EFR3_ARM 54-758 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778809.1`	Pfam	`PF21052`	EFR3_ARM	Repeat	54	758	9.7e-124	415.1	EFR3, armadillo repeat
`XP_057778811.1`	Pfam	`PF21052`	EFR3_ARM	Repeat	54	758	9.7e-124	415.1	EFR3, armadillo repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922828.1
GAAAAGAAAGGAAGAAAAAGGGCAAAAATGGCTTTGGAGTTCCCCAAGTTTCTGACAGACAAAGACAAAAGCAAAGCAATACTCTTTCGACTGCAATGACTCTGACAATCACGTGATCTCTCTCCCCATTCCCTCTATTCTCGTTCAATTTTTCTCCTGCACTAATCAACGTAACTTAAATATTCGGACACTCTCTCTCTCTCTTCTTTTCCACACTAGCTAATTCTTCGGTTGAAAAAGTTCCAACTTTGAAACGCTGG...

XM_057922826.1
GAAAAGAAAGGAAGAAAAAGGGCAAAAATGGCTTTGGAGTTCCCCAAGTTTCTGACAGACAAAGACAAAAGCAAAGCAATACTCTTTCGACTGCAATGACTCTGACAATCACGTGATCTCTCTCCCCATTCCCTCTATTCTCGTTCAATTTTTCTCCTGCACTAATCAACGTAACTTAAATATTCGGACACTCTCTCTCTCTCTTCTTTTCCACACTAGCTAATTCTTCGGTTGAAAAAGTTCCAACTTTGAAACGCTGG...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997501
ATGGGTGTCATTTCCCGAAAGATCTTTCCGGCATGCGAGAGCATGTGTGTTTGTTGTCCTGCTTTGAGGTCGCGGTCTCGCCAACCTGTTAAGCGTTACAAGAAATTGCTGTCTGAGATATTTCCAAAGTCTCCTGATGGTCATTCAAATGATCGAAAAATTGCGAAGCTATGTGAATATGCTTCTAAAAATCCATTCCGGATACCAAAGATTGCTAAATATCTTGAAGAAAGATGTTACAAAGAACTGCGAAGCGGTAA...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778809.1
MGVISRKIFPACESMCVCCPALRSRSRQPVKRYKKLLSEIFPKSPDGHSNDRKIAKLCEYASKNPFRIPKIAKYLEERCYKELRSGNVKLVSIVADIYNKLLCICKEQMVYFAVDLLNVVFELLDDSKQDTVLVIGCDTLTTFIYGQVDGTYTHNIENFVDKVCMLAHKTGDEHEKRGLRASSLRCLSAMVWFMAEFSHVFADFEKIVHATLDNYEMDSQNEEAEERNEAHHNWVDEVARSEGRGTTVVGGEFSPSHMII...

XP_057778811.1
MGVISRKIFPACESMCVCCPALRSRSRQPVKRYKKLLSEIFPKSPDGHSNDRKIAKLCEYASKNPFRIPKIAKYLEERCYKELRSGNVKLVSIVADIYNKLLCICKEQMVYFAVDLLNVVFELLDDSKQDTVLVIGCDTLTTFIYGQVDGTYTHNIENFVDKVCMLAHKTGDEHEKRGLRASSLRCLSAMVWFMAEFSHVFADFEKIVHATLDNYEMDSQNEEAEERNEAHHNWVDEVARSEGRGTTVVGGEFSPSHMII...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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