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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002909`

染色体: Chr08 坐标: 29060724-29065552 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002909`
名称	SmilChr08G002909
描述	rhodanese-like domain-containing protein 6
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29060724 - 29065552 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997511`
GeneID	`130997511`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997511`
原始查询	`LOC130997511`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	rhodanese-like domain-containing protein 6
产物	rhodanese-like domain-containing protein 6
Arabidopsis	`AT1G09280` (AT1G09280) rhodanese-like domain protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837449] identity=64; qcov=0.982; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os12g0563400` (OsStr18) - identity=56.6; qcov=1; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF03959 (FSH1); PF12368 (Rhodanese_C); PF17773 (UPF0176_N)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997511

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778829.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778829.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057778829.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778829.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778829.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29061147`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B13,C49,C8,D2,D7
`Chr8:29061903`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C49,D2
`Chr8:29061923`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B19,B80,C14,C18
`Chr8:29063960`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B22
`Chr8:29063991`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B102,B108,C59,D10
`Chr8:29064234`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C40,D6
`Chr8:29064248`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B140,C40,D6
`Chr8:29064707`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:29064848`	`AC`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A11,A7,B121,B135,B70,B79,C45,C60,D5
`Chr8:29065029`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B12
`Chr8:29065069`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C9
`Chr8:29065263`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B2

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778829.1

620 aa

310

620

UPF0176_N

Rhodanese_C

FSH1

PF17773 UPF0176_N 20-117 aa PF12368 Rhodanese_C 263-328 aa PF03959 FSH1 378-610 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778829.1`	Pfam	`PF17773`	UPF0176_N	Domain	20	117	1.6e-15	57.9	UPF0176 acylphosphatase like domain
`XP_057778829.1`	Pfam	`PF12368`	Rhodanese_C	Family	263	328	1.8e-14	54.5	Rhodanase C-terminal
`XP_057778829.1`	Pfam	`PF03959`	FSH1	Domain	378	610	3.5e-45	155.0	Serine hydrolase (FSH1)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922846.1
GAGAGTAACTGCTAAAACGGTCAGTCGCATCAACCCAAAATGTAAAAGACACTGTTTTGTTCCCACGCCCGATCAAAGCCCTAGGGTTTTACTTCTCGTATTCAAGGAAGCTCTCCCATCGTCAATGGCGGACTACTGCCTCAATCAGCAAACCAACCATGAAAATGGAAAGGACCACGGCGTGTTACTGTACTACAAGTACGCAGAAATCCCCAACATTCAATACCTCTTTGATTTCTACCATTCGAATTGCACCTCTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997511
ATGGCGGACTACTGCCTCAATCAGCAAACCAACCATGAAAATGGAAAGGACCACGGCGTGTTACTGTACTACAAGTACGCAGAAATCCCCAACATTCAATACCTCTTTGATTTCTACCATTCGAATTGCACCTCTCTCTCCCTCCTCGGTCGCGTCCGTCTCTCTTCCCAGGGCGTCAACGTCACTGTTGGGGGGAGATTGACGGCATTGGAGGAACACATTGAGGTAGTGAAATCTAACCCTCTGTTTGAAGGAACCGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778829.1
MADYCLNQQTNHENGKDHGVLLYYKYAEIPNIQYLFDFYHSNCTSLSLLGRVRLSSQGVNVTVGGRLTALEEHIEVVKSNPLFEGTDFKLASCSEPLSDQVAKECGFTSLSIRIVKELVTLSSHPLLKSPEISNAGRHLSAAEFHSVLQNAGDCQELSSGSNKELILLDARNLYETRIGKFHAPDIKTLDPAIRQYSDLPSWIDDNSEQLRGNNILMYCTGGIRCEMASAYIRSKGAGFENVFQLYGGIQRYMEQFPDGG...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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