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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002913`

染色体: Chr08 坐标: 29101326-29104559 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002913`
名称	SmilChr08G002913
描述	ABC transporter I family member 20
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29101326 - 29104559 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997515`
GeneID	`130997515`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997515`
原始查询	`LOC130997515`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ABC transporter I family member 20
产物	ABC transporter I family member 20
Arabidopsis	`AT5G02270` (ABCI20) non-intrinsic ABC protein 9 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831709] identity=79.9; qcov=1.02; evalue=1.67e-179; confidence=high
Rice	`Os03g0316900` (OsABCI15) - identity=78.2; qcov=0.997; evalue=1.71e-173; confidence=high
GO	GO:0005524 (ATP binding); GO:0016887 (ATP hydrolysis activity)
KEGG	smil03018 (RNA degradation - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00005 (ABC_tran); PF13304 (AAA_21)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997515

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778833.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057778833.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057778833.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778833.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778833.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29101684`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A24
`Chr8:29102431`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	frameshift_variant	4	A3,B24,B65,C74
`Chr8:29102431`	`T`	`TAC`	2bp_insertion	CDS_variant	4	A3,B24,B65,C74

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778833.1

318 aa

159

318

ABC_tran

AAA_21

PF00005 ABC_tran 37-182 aa PF13304 AAA_21 150-213 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778833.1`	Pfam	`PF00005`	ABC_tran	Domain	37	182	6.1e-18	66.5	ABC transporter
`XP_057778833.1`	Pfam	`PF13304`	AAA_21	Domain	150	213	2e-12	48.4	AAA domain, putative AbiEii toxin, Type IV TA system

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922850.1
AATTAATTAAATCTGAAATCAATTTAATTTCAATTTGTGATAACGTGTATATCTGTGAATCATGAGATCTGAAACATGGTGCGGCGTTTAATTCCAACTGCCCATCTACACTAATAAACTGGTAACAAGCGCTCCAATTGAAGCCACGACATCGAGCTTGCGTCTACCAAACTCCATCGTCTACAAAAACATCGTCACCTCACCGCGAAGCTAGACAGCTATGGTGGTGGAGGTGGAAAAATCTCACCCGACAGTGCAGG...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997515
ATGGTGGTGGAGGTGGAAAAATCTCACCCGACAGTGCAGGTCACCAAGCTCAAATTCACCTATCCGGGAATCGACGGTCATCCTCCGCCCGGCGCAAAGCCTCTCATTGATGATTTCAATCTCTCTCTCTTCGCCGGCGACCGCTGCCTTCTTGTCGGCTCCAATGGCGCAGGGAAAACAACTATCTTGAAAATTATTGGAGGGAAGCACATGGTGGAGCAGGAAACTGTTAGGGTTTTGGGAAGATCAGCGTTTCACGA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778833.1
MVVEVEKSHPTVQVTKLKFTYPGIDGHPPPGAKPLIDDFNLSLFAGDRCLLVGSNGAGKTTILKIIGGKHMVEQETVRVLGRSAFHDTALTASGDLSYLGGEWRREVAFAGYEVPIQMDVSADKMIFGVAGVDPKRRDELIKVLGIDLSWRMHKVSDGQRRRVQICMGLLKTFKVLLLDEITVDLDVLARADLLKFLKKECEERGATIIYATHIFDGLEDWPSHIVYVAHGKLQLTMPMNEIKELSNLSLMRTVERWLRK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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