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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002931`

染色体: Chr08 坐标: 29351015-29353483 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002931`
名称	SmilChr08G002931
描述	plant cysteine oxidase 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29351015 - 29353483 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997534`
GeneID	`130997534`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997534`
原始查询	`LOC130997534`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	plant cysteine oxidase 2-like
产物	plant cysteine oxidase 2-like
Arabidopsis	`AT5G15120` (AT5G15120) 2-aminoethanethiol dioxygenase, putative (DUF1637) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831364] identity=44; qcov=0.871; evalue=2.36e-67; confidence=medium
Rice	`Os12g0623600` - identity=49.8; qcov=0.851; evalue=1.06e-83; confidence=high
GO	GO:0016702 (oxidoreductase activity, acting on single donors with incorporation of molecular oxygen, incorporation of two atoms of oxygen)
KEGG	-
Pfam	PF07847 (PCO_ADO)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997534

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytosol	细胞质基质	1.00000	`XP_057778855.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778855.1`
3	Nucleus	细胞核	0.60000	`XP_057778855.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778855.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778855.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29351399`	`TA`	`T`	1bp_deletion	frameshift_variant	1	B26
`Chr8:29351399`	`TA`	`T`	1bp_deletion	CDS_variant	1	B26

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778855.1

295 aa

148

295

PCO_ADO

PF07847 PCO_ADO 86-289 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778855.1`	Pfam	`PF07847`	PCO_ADO	Family	86	289	1.2e-68	231.3	PCO_ADO

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922872.1
GGCAGTTTTATTTGCAATCTTGGGGGCGGGAAATCAAACTGCCTTGTTTCCTTTTCTAGAGTTTTCCATAATATATAAATGGTTTTCCCTTCAAATCAAAATACTATCTTCATCCCTCTCCCACTTTACCGCCTATGGCCCCTGGTTTTTCCCTCTCTCTCTACCACCCTTTTCAAACCCCCATCCACCGTTATCCTCTGACTTTTACTTCCATCTTCTGCCCTTATCTATTCATCTCTGTCCTCTTCCAGATCCGTTAT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997534
ATGCCGGAAATAGGATTCAGTTTCAGGATTGATCAAATGACAGTTGAAGCGGCGGGTTTTGTGAGAAGATCGGATGAAGCTTCGCACCATGTTGATAAGGTGATAAAGAAGAGGAGAGGTCGGAAGAGGCTCAGGATTCAATTGAGGCGCCCCTCGAATGCTGGGACTCTGCAGCACCTCTTTCACTGTTGCCAAACACTTTTCAAGGGCCCCGGCACTGTTCCTTGTGCTTCTGATGTGCAAAATTTGTGTCGTATTCT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778855.1
MPEIGFSFRIDQMTVEAAGFVRRSDEASHHVDKVIKKRRGRKRLRIQLRRPSNAGTLQHLFHCCQTLFKGPGTVPCASDVQNLCRILDGMKPEDVGLSKDLHFFKPKSEIDGAPRVTSATIYKCDKFELCIFFLPETAVIPLHNHPEMTVFNKLLLGTMHIKAYDWVDPLTSDCSLSNSKHVDGSSVRLAKLKANRRFTAPCDTSVLYPTSGGNIHEFTAITPCAFLDVIGPPYSKDDGRDCTFYQEVHALPDTEEFRKL...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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