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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002940`

染色体: Chr08 坐标: 29412749-29417017 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002940`
名称	SmilChr08G002940
描述	uncharacterized SmilChr08G002940
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29412749 - 29417017 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997543`
GeneID	`130997543`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997543`
原始查询	`LOC130997543`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ArgH (DUF639) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816709]; symbol=AT2G21720; hit=AT2G21720; species=arabidopsis; confidence=high
产物	ArgH (DUF639) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816709]; symbol=AT2G21720; hit=AT2G21720; species=arabidopsis; confidence=high
Arabidopsis	`AT2G21720` (AT2G21720) ArgH (DUF639) [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:816709] identity=56.4; qcov=0.985; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0157700` (OJ1134F05.2) - identity=49.4; qcov=0.984; evalue=0; confidence=high
GO	-
KEGG	-
Pfam	PF04842 (DUF639)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997543

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Endoplasmic reticulum	内质网	1.00000	`XP_057778866.1`
2	Endoplasmic reticulum membrane	内质网膜	1.00000	`XP_057778866.1`
3	Nucleus membrane	核膜	0.20000	`XP_057778866.1`
4	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778866.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778866.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29413050`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B33,B49,C32,C68
`Chr8:29413563`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A18,B40
`Chr8:29413701`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6
`Chr8:29413969`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:29414192`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B66,B68,B8,D6
`Chr8:29414877`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B24,C31
`Chr8:29415530`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr8:29415972`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D6

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778866.1

677 aa

338

677

DUF639

PF04842 DUF639 439-666 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778866.1`	Pfam	`PF04842`	DUF639	Family	439	666	4e-62	210.4	Plant protein of unknown function (DUF639)

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922883.1
CATGTAGACAGCAGTTAGCATGATATACCGGATCGCCTCCTTCAATTCACAATCCCATTAATTATTCTGCAATTTTGCATTATTATGAATATGGAGAAGAAGAAGAAGAAGCATCTTTCATCCATTGCTAACCACGTTATTGGAACATGCGCCCAAAAGCTCGATTCCTCTGTGGATCATCTGATTCAAGAATTCGAGAGAGGATGGAAGCCTGAAATGGATAGTTACTCAAAGAAACTAGTAGAATTCTGCTGTACAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997543
ATGAATATGGAGAAGAAGAAGAAGAAGCATCTTTCATCCATTGCTAACCACGTTATTGGAACATGCGCCCAAAAGCTCGATTCCTCTGTGGATCATCTGATTCAAGAATTCGAGAGAGGATGGAAGCCTGAAATGGATAGTTACTCAAAGAAACTAGTAGAATTCTGCTGTACAAAAGCACTTGCACTCCTGTGTGGAACCATAGATGAAACAATCAGCAACGGCTCTTTTAGCCGCTTCACATTTGATATGATGCTGGC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778866.1
MNMEKKKKKHLSSIANHVIGTCAQKLDSSVDHLIQEFERGWKPEMDSYSKKLVEFCCTKALALLCGTIDETISNGSFSRFTFDMMLAWEMPSSTDEESHSESMAKEKEERKVPAVTNKIQDDVSIFYTDLMPLLVDREPSAGEDAFVWLGTLVPLVVDIVNGRFTYDTLTAPTANRLHFPAYDKFLKEIQRCIKHLQKQDTPAGVELADDEFILHVEGTASSNRVVRHIGGTSWPGRLTLTNYALYFEASGIVSYEDALK...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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