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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002952`

染色体: Chr08 坐标: 29542057-29544637 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002952`
名称	SmilChr08G002952
描述	receptor-like cytoplasmic kinase 176
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29542057 - 29544637 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997554`
GeneID	`130997554`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997554`
原始查询	`LOC130997554`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	receptor-like cytoplasmic kinase 176
产物	receptor-like cytoplasmic kinase 176
Arabidopsis	`AT2G28930` (PK1B) protein kinase 1B [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:817442] identity=67.7; qcov=1.01; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os05g0110900` (OsRLCK176) - identity=66; qcov=0.981; evalue=0; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997554

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cell membrane	细胞膜	1.00000	`XP_057778897.1`
2	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778897.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778897.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778897.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057778897.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29542845`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B108,C33
`Chr8:29543229`	`G`	`GCT`	2bp_insertion	frameshift_variant	21	A14,A22,A6,B104,B124,B131,B21,B62,B66,C1,C14,C24,C31,C42,C45,C56,C59,C61,C65,C84,D9
`Chr8:29543233`	`CGT`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	22	A14,A22,A6,B104,B123,B124,B131,B21,B62,B66,C1,C14,C24,C31,C42,C45,C56,C59,C61,C65,C84,D9
`Chr8:29543460`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:29543703`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104
`Chr8:29543727`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:29543820`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr8:29544016`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D2
`Chr8:29544125`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr8:29544217`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	frameshift_variant	1	C25
`Chr8:29544217`	`CAG`	`C`	2bp_deletion	CDS_variant	1	C25
`Chr8:29544292`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778897.1

414 aa

207

414

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 81-357 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 82-360 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778897.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	81	357	3.2e-46	158.6	Protein kinase domain
`XP_057778897.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	82	360	2.1e-48	165.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922914.1
AATTGTCTTGTGCTAGGAAAAACAAGTTGAAAGTCAAAGTTTCATACGCCCCACAATTGCAAACGTCTAAAAAAGGCTTCTTCATGTATGACCGACTCATCCAAACGCAACAAGACGACTTGGCTTAGATATAATCCACCAACCCTCCTCTCAAATTTTCCATAATTCCAATTCCATCTTTCCCTGCTACTATTTCCCTTTTTTTGTGTTTCCTTTTTTCACATAAAAAAGTTGAAGAAGATCTTCTCTTTTTACAATCA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997554
ATGGGGATCTGTTTGAGCAACCAGATAAAGGCTGAGAGCCCTTTTCATACTGGCACAGGTGCAAGTTCGTCTAAAATGATAAGTGGAGATGGGACGGAGTTAAGCAATTCGGGGAGCAGCAAGAGATCCTCTGCATCCATACCTCCAACTCCTCGGAGTGAAGGTGAGATATTGCAATCCTCCAACATGAAAAGCTTCGCCTTCAGCGATCTCAAGGCCGCCACGCGAAACTTTCGCCCCGACAGCGTGTTGGGGGAGGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778897.1
MGICLSNQIKAESPFHTGTGASSSKMISGDGTELSNSGSSKRSSASIPPTPRSEGEILQSSNMKSFAFSDLKAATRNFRPDSVLGEGGFGSVFKGWIDEYSLAASKPGSSMVVAVKRLNQDGWQGHKEWLAEINYLGQLRHPNLVKLIGYCLEDDHRLLVYEFMPKGSMENHLFRRGSYFQPLSWSLRVKIALGAARGLAFLHNAETKVIYRDFKTSNILLDSNYNAKLSDFGLARDGPTGDKSHVSTRVMGTYGYAAPE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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