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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002965`

染色体: Chr08 坐标: 29669643-29672224 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002965`
名称	SmilChr08G002965
描述	probable protein phosphatase 2C 4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29669643 - 29672224 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997563`
GeneID	`130997563`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997563`
原始查询	`LOC130997563`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	probable protein phosphatase 2C 4
产物	probable protein phosphatase 2C 4
Arabidopsis	`AT1G07630` (PLL5) pol-like 5 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:837276] identity=55.6; qcov=1.08; evalue=0; confidence=high
Rice	`Os03g0821300` (XB15) - identity=49.5; qcov=1.02; evalue=1.95e-179; confidence=high
GO	GO:0004722 (protein serine/threonine phosphatase activity); GO:0006470 (protein dephosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00481 (PP2C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997563

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	0.40000	`XP_057778910.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057778910.1`
3	Chloroplast	叶绿体	0.20000	`XP_057778910.1`
4	Chloroplast membrane	叶绿体膜	0.20000	`XP_057778910.1`
5	Nucleus	细胞核	0.00000	`XP_057778910.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29669910`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B88
`Chr8:29669952`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr8:29669985`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C39
`Chr8:29670291`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B41,C70,C82,C86
`Chr8:29670785`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B73
`Chr8:29671566`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	frameshift_variant	2	B31,C76
`Chr8:29671566`	`A`	`AGT`	2bp_insertion	CDS_variant	2	B31,C76
`Chr8:29671588`	`C`	`CTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A1,B107,B128,B34,B79,C11,C30,C68
`Chr8:29671590`	`T`	`TTG`	2bp_insertion	frameshift_variant	8	A1,B107,B128,B34,B79,C11,C30,C68
`Chr8:29671608`	`T`	`TC`	1bp_insertion	frameshift_variant	5	A1,B107,B34,C11,C87
`Chr8:29671608`	`T`	`TC`	1bp_insertion	CDS_variant	5	A1,B107,B34,C11,C87
`Chr8:29671714`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778910.1

620 aa

310

620

PP2C

PF00481 PP2C 324-559 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778910.1`	Pfam	`PF00481`	PP2C	Family	324	559	5.6e-31	108.8	Protein phosphatase 2C

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922927.1
CAACGCCCTCAAGCCACAAAAATCCAAAGCATAGAATATTTTAAAACAAATCCAACTTTTAATTTCAAAGTCAACTCTCACCATTTATCTTCTTCTCTCCCGAGCACCTACAACCTCTCTCTCTCTGTCTCTCTCTCTTCACCTCCAAATCATGAACTTTCAACTTCAACCCTTTTAACCTCCTCTGCTTCTCCTCTTCCCTCTCCTACGCAGAAACGAGAAAAGAACATTCATTCTTTCTCTCTCTCCGAATGGGAAAC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997563
ATGGGAAACGGAATCGGAAAGCTCAGCCTCTGCTTCGCCGGAGACGCCGGCGAGATTTCCCGGCGGAGAAATGACATCGCCGTCTGTCTGTCCGAGCCTCTCGACGAGGGCTTGGGCCACTCTTTCTGCTACATACCCTCCGAGAATCTCCAAAAATCCCAATCCTTGGATGATCCCGCTGCCCCATACACGCCGGCCTTCCGCACCATATCGGGCGCCGCCATCTCCGCCAACACCTCCACGCCGCTCTCCACCGACCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778910.1
MGNGIGKLSLCFAGDAGEISRRRNDIAVCLSEPLDEGLGHSFCYIPSENLQKSQSLDDPAAPYTPAFRTISGAAISANTSTPLSTDPFAYTTLDKASTFESSNFFSSIPLQPIPKNSLHTVKSGPIIRTSGSGPMDRGFLSGPIERSFISGPLDNQFDQLHRYRPKSKKLALVKNFKKVISKSFWSFYREISSSERENNNGVISGTNSGNSSTITSHNLSSEMSLVDENDDAGNECFGSQNLQWAQGKAGEDRVHIVISE...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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