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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002970`

染色体: Chr08 坐标: 29727944-29731570 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002970`
名称	SmilChr08G002970
描述	uncharacterized SmilChr08G002970
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29727944 - 29731570 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997569`
GeneID	`130997569`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997569`
原始查询	`LOC130997569`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831780]; symbol=AT5G02430; hit=AT5G02430; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831780]; symbol=AT5G02430; hit=AT5G02430; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G02430` (AT5G02430) Transducin/WD40 repeat-like superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831780] identity=44.2; qcov=1.02; evalue=0; confidence=medium
Rice	`Os11g0187100` (OsWD40-185) - identity=36.9; qcov=0.964; evalue=2.06e-145; confidence=medium
GO	GO:0005515 (protein binding)
KEGG	-
Pfam	PF00400 (WD40)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997569

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasm	细胞质	1.00000	`XP_057778916.1`
2	Cytosol	细胞质基质	0.80000	`XP_057778916.1`
3	Cytoskeleton	细胞骨架	0.40000	`XP_057778916.1`
4	Cell membrane	细胞膜	0.20000	`XP_057778916.1`
5	Ruffle	Ruffle	0.20000	`XP_057778916.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29728291`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B100
`Chr8:29728345`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B13,C8,D7
`Chr8:29728393`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	A18,B75,C34
`Chr8:29728547`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B3,B72,C11,C69
`Chr8:29728624`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B89,B99
`Chr8:29728805`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B107,B15,C15
`Chr8:29728856`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C31
`Chr8:29728915`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D4
`Chr8:29728936`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B1,B87,C42,C59
`Chr8:29728976`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	B10,B28,B32,C61
`Chr8:29729188`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C12
`Chr8:29729221`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A4

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778916.1

901 aa

450

901

WD40

PF00400 WD40 389-422 aa PF00400 WD40 499-535 aa PF00400 WD40 540-577 aa PF00400 WD40 706-730 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778916.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	389	422	4.3e-36	122.5	WD domain, G-beta repeat
`XP_057778916.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	499	535	4.3e-36	122.5	WD domain, G-beta repeat
`XP_057778916.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	540	577	4.3e-36	122.5	WD domain, G-beta repeat
`XP_057778916.1`	Pfam	`PF00400`	WD40	Repeat	706	730	4.3e-36	122.5	WD domain, G-beta repeat

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922933.1
AATATAATCCTTGAAAAATGATTGAAATCGCAGCCGAAAAGGTGTAAAGACTTATGAAATCTATCCACCATTTCTTTCTCCCCCAAATTTCGGACACAATATAACCGGCTTATAGTTATGTCCCTAGTTTCCCTCTCTTCCACCACTCACTCTCCCAGCTCGCAAAACATTCTCGCCAAACACCACGATTCTTGAAAATATCATTTCCCAAAACTAGAAACTCGATTCATTATGTGATTTTTTTCTTTTCTCTTAGTTCT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997569
ATGAATCGGACGGTGAGCATAAGCTTGGACGACGATGACTTCTTCGACTCGTGCGACAGGCTATCGTCCGTGGTGGCCGTGGACCTCGCCTCCCTCTCCGACGACGACGACGACGAGTTCTACGAGGCGAGCCGCATGTCCTTCGCGAGAGGCGGCGCCTCCATCAAGCGCATCTACTCCATCGCGCCGGTGCGACCCGACCCCTCCGCCGCCATCCCACCCGCCTACGACATGTGGATCGCGGAGCCCGGCGACGTGAA...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778916.1
MNRTVSISLDDDDFFDSCDRLSSVVAVDLASLSDDDDDEFYEASRMSFARGGASIKRIYSIAPVRPDPSAAIPPAYDMWIAEPGDVKERRKRLLQGMGLVSNKDLLRIASSKVVRTVSIKANAPAAEPANEQQEKDADDKPKAQAVAVPVRAIVLVRSRSDGDIDVFSTKTKQRKLELIGPVSKNKLIRTMSGQLVPSTSSAIKVVREKTEHRRAPSEHSVGVVQDASIGSFFLIKNLDTGTDFIVKEFNEEGMWNKLND...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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