当前解析结果
SmilChr08G002988| 统一新 Gene ID | SmilChr08G002988 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G002988 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G002988 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 29987810 - 29988361 / - |
| NCBI Gene ID | LOC130997585 |
|---|---|
| GeneID | 130997585 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997585 |
| 原始查询 | LOC130997585 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | forkhead box protein G1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818329]; symbol=AT2G37530; hit=AT2G37530; species=arabidopsis; confidence=medium |
| 产物 | forkhead box protein G1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818329]; symbol=AT2G37530; hit=AT2G37530; species=arabidopsis; confidence=medium |
| Arabidopsis | AT2G37530 (AT2G37530)forkhead box protein G1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818329] identity=53.3; qcov=0.764; evalue=8.84e-33; confidence=medium |
| Rice | Os12g0566600- identity=38.6; qcov=0.721; evalue=6.8e-16; confidence=low |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997585 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Chloroplast | 叶绿体 | 1.00000 | XP_057778935.1 |
| 2 | Chloroplast membrane | 叶绿体膜 | 0.60000 | XP_057778935.1 |
| 3 | Chloroplast thylakoid | 类囊体 | 0.20000 | XP_057778935.1 |
| 4 | Chloroplast thylakoid membrane | 类囊体膜 | 0.20000 | XP_057778935.1 |
| 5 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057778935.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:29988297 |
T |
TAG |
2bp_insertion | frameshift_variant | 34 | A16,B10,B102,B104,B11,B113,B119,B128,B130,B16,B51,B63,B71,B8,B81,B88,B89,C10,C14,C17,C23,C24,C28,C38,C51,C57,C58,C59,C83,D10,D11,D4,D7,D9 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。