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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G002987`

染色体: Chr08 坐标: 29983626-29984172 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G002987`
名称	SmilChr08G002987
描述	histone H4
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	29983626 - 29984172 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997586`
GeneID	`130997586`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997586`
原始查询	`LOC130997586`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	histone H4
产物	histone H4
Arabidopsis	`AT3G53730` (AT3G53730) Histone superfamily protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824540] identity=100; qcov=1; evalue=2.99e-68; confidence=high
Rice	`Os04g0583600` (OSJNBb0064P21.1) - identity=100; qcov=1; evalue=2.04e-68; confidence=high
GO	GO:0000786 (nucleosome); GO:0003677 (DNA binding); GO:0006334 (nucleosome assembly); GO:0030527 (structural constituent of chromatin); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF02969 (TAF); PF15511 (CENP-T_C)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997586

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778937.1`
2	Chromosome	染色体	1.00000	`XP_057778937.1`
3	Chromatin	染色质	0.20000	`XP_057778937.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057778937.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778937.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:29983805`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A19,C9
`Chr8:29983825`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B80
`Chr8:29983892`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B10,B53,B65,B85,D9
`Chr8:29983898`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	A18,B33,B49,C32,C68
`Chr8:29983964`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B66
`Chr8:29984101`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C27

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778937.1

103 aa

103

TAF

CENP-T_C

PF02969 TAF 34-92 aa PF15511 CENP-T_C 44-96 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778937.1`	Pfam	`PF02969`	TAF	Domain	34	92	0.00014	22.7	TATA box binding protein associated factor (TAF)
`XP_057778937.1`	Pfam	`PF15511`	CENP-T_C	Domain	44	96	2.5e-08	34.7	Centromere kinetochore component CENP-T histone fold

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922954.1
CCACCAACCATTCACACAATCTAAATTGAAAAAAAACTCGTCATTTATTCATCATCAACAAAATGTCTGGGCGCGGCAAAGGAGGCAAGGGTTTGGGAAAGGGAGGAGCGAAACGACACCGTAAGGTGTTGAGAGATAACATTCAGGGGATCACGAAGCCGGCCATCCGTCGTCTGGCTCGTCGTGGTGGTGTCAAGCGTATCAGCGGCCTCATCTATGAGGAGACTCGTGGCGTGCTCAAGATCTTTTTGGAGAATGTC...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997586
ATGTCTGGGCGCGGCAAAGGAGGCAAGGGTTTGGGAAAGGGAGGAGCGAAACGACACCGTAAGGTGTTGAGAGATAACATTCAGGGGATCACGAAGCCGGCCATCCGTCGTCTGGCTCGTCGTGGTGGTGTCAAGCGTATCAGCGGCCTCATCTATGAGGAGACTCGTGGCGTGCTCAAGATCTTTTTGGAGAATGTCATCCGCGATGCTGTCACCTACACCGAGCACGCTCGCCGGAAAACTGTCACCGCCATGGATGT...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778937.1
MSGRGKGGKGLGKGGAKRHRKVLRDNIQGITKPAIRRLARRGGVKRISGLIYEETRGVLKIFLENVIRDAVTYTEHARRKTVTAMDVVYALKRQGRTLYGFGG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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