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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003005`

染色体: Chr08 坐标: 30122548-30127311 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003005`
名称	SmilChr08G003005
描述	ras-related protein RABE1c-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30122548 - 30127311 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997603`
GeneID	`130997603`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997603`
原始查询	`LOC130997603`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; KEGG smil; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	ras-related protein RABE1c-like
产物	ras-related protein RABE1c-like
Arabidopsis	`AT5G59840` (AT5G59840) Ras-related small GTP-binding family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:836105] identity=92.2; qcov=0.953; evalue=5.86e-141; confidence=high
Rice	`Os07g0239400` (OsRab8A3) - identity=91.6; qcov=1; evalue=4.5e-137; confidence=high
GO	GO:0003924 (GTPase activity); GO:0005525 (GTP binding); GO:0005886 (plasma membrane); GO:0006904 (GO:0006904); GO:0009306 (protein secretion); GO:0017157 (regulation of exocytosis)
KEGG	smil04144 (Endocytosis - Salvia miltiorrhiza (redroot sage))
Pfam	PF00009 (GTP_EFTU); PF00025 (Arf); PF00071 (Ras); PF01926 (MMR_HSR1); PF08477 (Roc)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997603

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Cytoplasmic vesicle	细胞质囊泡	1.00000	`XP_057778956.1`
2	Golgi apparatus	高尔基体	1.00000	`XP_057778956.1`
3	Trans-golgi network	Trans-golgi network	1.00000	`XP_057778956.1`
4	Vesicle	囊泡	1.00000	`XP_057778956.1`
5	Endosome	内体	1.00000	`XP_057778956.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30126136`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B90,C25
`Chr8:30126961`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	B15,C15
`Chr8:30126976`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	D10

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778956.1

215 aa

108

215

Arf

Roc

Ras

MMR_HSR1

GTP_EFTU

PF00025 Arf 16-170 aa PF08477 Roc 17-131 aa PF00071 Ras 17-178 aa PF01926 MMR_HSR1 18-129 aa PF00009 GTP_EFTU 49-173 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778956.1`	Pfam	`PF00025`	Arf	Domain	16	170	2.5e-15	57.1	ADP-ribosylation factor family
`XP_057778956.1`	Pfam	`PF08477`	Roc	Domain	17	131	4.8e-35	121.1	Ras of Complex, Roc, domain of DAPkinase
`XP_057778956.1`	Pfam	`PF00071`	Ras	Domain	17	178	1.8e-68	229.9	Ras family
`XP_057778956.1`	Pfam	`PF01926`	MMR_HSR1	Family	18	129	1.3e-05	26.0	50S ribosome-binding GTPase
`XP_057778956.1`	Pfam	`PF00009`	GTP_EFTU	Domain	49	173	2.3e-07	31.3	Elongation factor Tu GTP binding domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922973.1
ATTCTAGAGGAGTGGAAATGTAGAATAGTGTCAATCCAATAATTATGGGCCTCATCCAGGCTGTCCCAAATATGAAATATCAAATCAAACCATATAAAAAGTCCAAAGTTTCTTATTTACTAAGTCACACACATATTCGCGACCCCTTCTTCTCCATTGCCAATTGCATACTTTTAAAGCCAAATTCTGCCATTAATTTATTCAGCAAATTGGAATTCAAACAATAGTGTGAAAAATAAACCAATAAATAAAAATAAAAA...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997603
ATGGCCGCTCCACCCGCCAGAGCACGAGCCGATTATGATTGCCTCATCAAGCTTCTCTTGATCGGTGATAGCGGTGTGGGTAAGAGTTGCCTTCTTTTACGTTTTTCTGATGGTTCTTTCACCACCAGTTTCATTACCACTATTGGGATTGATTTTAAGATAAGAACTATTGAGCTTGATGGTAAAAGAATCAAACTGCAAATATGGGATACTGCTGGACAAGAGCGATTTCGTACTATAACAACTGCTTACTATCGTGG...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778956.1
MAAPPARARADYDCLIKLLLIGDSGVGKSCLLLRFSDGSFTTSFITTIGIDFKIRTIELDGKRIKLQIWDTAGQERFRTITTAYYRGAMGILLVYDVTDEASFNNIRNWIRNIEQHASDNVNKILVGNKADMDESKRAVPTSKGQALADEYGIKFFETSAKTNMNVEEVFFSIARDIKQRLAESDSKTEPQTIKITQPDQNAGAAQAASKSACCG

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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