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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003014`

染色体: Chr08 坐标: 30244336-30250280 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003014`
名称	SmilChr08G003014
描述	serine/threonine-protein kinase AFC1
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30244336 - 30250280 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997614`
GeneID	`130997614`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997614`
原始查询	`LOC130997614`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	serine/threonine-protein kinase AFC1
产物	serine/threonine-protein kinase AFC1
Arabidopsis	`AT3G53570` (FC1) serine/threonine-protein kinase AFC1 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:824525] identity=88.7; qcov=0.965; evalue=2.36e-150; confidence=high
Rice	`Os01g0837900` - identity=85.2; qcov=0.996; evalue=1.27e-142; confidence=high
GO	GO:0004672 (protein kinase activity); GO:0005524 (ATP binding); GO:0005634 (nucleus); GO:0006468 (protein phosphorylation)
KEGG	-
Pfam	PF00069 (Pkinase); PF07714 (PK_Tyr_Ser-Thr)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997614

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778974.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778974.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.60000	`XP_057778974.1`
4	Nucleoplasm	核质	0.40000	`XP_057778975.1`
5	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778974.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30249039`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	C22,C4,C43
`Chr8:30249568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	stop_gained	3	B131,B2,C23
`Chr8:30249568`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B131,B2,C23
`Chr8:30249906`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	3	B120,B139,C75

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778974.1

432 aa

216

432

Pkinase

PK_Tyr_Ser-Thr

PF00069 Pkinase 94-422 aa PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 96-332 aa

XP_057778975.1

230 aa

115

230

PK_Tyr_Ser-Thr

Pkinase

PF07714 PK_Tyr_Ser-Thr 4-130 aa PF00069 Pkinase 55-220 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778974.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	94	422	1.3e-50	172.9	Protein kinase domain
`XP_057778974.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	96	332	3e-21	76.6	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057778975.1`	Pfam	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	Domain	4	130	5.5e-09	36.4	Protein tyrosine and serine/threonine kinase
`XP_057778975.1`	Pfam	`PF00069`	Pkinase	Domain	55	220	2.1e-32	113.3	Protein kinase domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057922991.1
GACAGAACAGATAGCGATTTTAAAATACCCCTTAACCCATGTGGATTTTAACTGTGATTAACTAACTACGGTTACTTTCCCCTCGTCTCCTCTCATTACAGCTTTTCTGTTTCGCTTCTCAAATCTGTTCAATCTTTATGGGGGAAAATAAAGAAACAAGAAATTAACGACATTATTTGCCCTAGATGAGATTTTGATTTCAAAATTTTCCGGAGATTATCTCATTTTTGGCTTGTTTTCTCGTCCTTGACTAAGTATGA...

XM_057922992.1
CTTTTGGGCAAGTTTTAGAATGTCTGGACAATGAAAGAAAAGAGATAGTTGCTATCAAAGTTGTTCGTTCAATACAAAAGTACCGTGAAGCCGCAATGATTGAAATTGATGTCTTACAGAAACTAGCAAGGCATGATATCTGCGGTACACGTTATGCATGATCTTCGCCTGATTCACACTGATTTAAAACCAGAAAATATTCTTCTGGTGTCCTCAGAATATATCAAAGTTCCAGATTATAAGTTTTTATCAAGATCTGC...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997614
ATGGAGACACAGAGAGTGGTGGAATTTCCTCATAGGAGCATGGATAAAAGGCCTCGGAAACGACCTCGTTTGACATGGGATCTGACGCCGACTGTTCCTCCTGCTCCTCCAAAGATTCTTCCAACTATATACTGTGCCCAAGAGTTTGGTGCTGTCCCTAGTTACGCATGTTCATCAATATATTATAAAGGGATTCCGCGTAATGGTTCTCCACCTTGGAGACCTGATGATAAAGATGGGCACTATGTTTTTGCTATTGG...

LOC130997614
ATGATATCTGCGGTACACGTTATGCATGATCTTCGCCTGATTCACACTGATTTAAAACCAGAAAATATTCTTCTGGTGTCCTCAGAATATATCAAAGTTCCAGATTATAAGTTTTTATCAAGATCTGCAAAAGACGGTTCCTACTTCAAAAATCTACCTAAATCAAGTGCTATAAAGCTTATTGATTTTGGTAGTACTACTTTTGAACATCAAGATCACAGCTATGTAGTGTCTACACGCCATTATCGTGCACCAGAGGT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057778974.1
METQRVVEFPHRSMDKRPRKRPRLTWDLTPTVPPAPPKILPTIYCAQEFGAVPSYACSSIYYKGIPRNGSPPWRPDDKDGHYVFAIGENLTPRYRILSKMGEGTFGQVLECLDNERKEIVAIKVVRSIQKYREAAMIEIDVLQKLARHDICGTRCVQIRNWFDYRNHICIVFEKLGPSLYDFLRKNSYRSFPIDLVREFGRQLLESVAFMHDLRLIHTDLKPENILLVSSEYIKVPDYKFLSRSAKDGSYFKNLPKSSAI...

XP_057778975.1
MISAVHVMHDLRLIHTDLKPENILLVSSEYIKVPDYKFLSRSAKDGSYFKNLPKSSAIKLIDFGSTTFEHQDHSYVVSTRHYRAPEVILGLGWNYPCDMWSIGCILVELCSGEALFQTHENLEHLAMMERVLGPLPPNMIMRADRRTEKYFRRGTRLDWPEGATSRESMRAVWKLPRLPNLIMQHVDHSAGDLIDLLQGLLRYDPAERLKAREALGHPFFTRDLRRFGYL

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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