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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003022`

染色体: Chr08 坐标: 30355447-30357071 链方向: - 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003022`
名称	SmilChr08G003022
描述	protein SODIUM POTASSIUM ROOT DEFECTIVE 2-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30355447 - 30357071 / `-`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997621`
GeneID	`130997621`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997621`
原始查询	`LOC130997621`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protein SODIUM POTASSIUM ROOT DEFECTIVE 2-like
产物	protein SODIUM POTASSIUM ROOT DEFECTIVE 2-like
Arabidopsis	`AT2G37390` (NAKR2) Chloroplast-targeted copper chaperone protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818315] identity=41.3; qcov=1.13; evalue=7.48e-43; confidence=medium
Rice	`Os03g0819400` (OJ1754_E06.11) - identity=41.4; qcov=0.842; evalue=2.85e-36; confidence=medium
GO	GO:0046872 (metal ion binding)
KEGG	-
Pfam	PF00403 (HMA)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997621

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057778988.1`
2	Cytoplasm	细胞质	0.80000	`XP_057778988.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.40000	`XP_057778988.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057778988.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057778988.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30356032`	`GAA`	`G`	2bp_deletion	frameshift_variant	27	A18,A4,B103,B105,B129,B130,B133,B19,B26,B50,B51,B75,B76,B78,B87,B95,C17,C34,C35,C47,C55,C65,C70,C74,C84,C85,D3
`Chr8:30356121`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C8,D7
`Chr8:30356356`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	4	A22,B101,B25,D11

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057778988.1

215 aa

108

215

HMA

PF00403 HMA 133-179 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057778988.1`	Pfam	`PF00403`	HMA	Domain	133	179	2.3e-11	44.6	Heavy-metal-associated domain

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

1 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923005.1
ATGAGAAATGAAACCAATGATCAACTTAGTGTAACAAATTATGAAAGTTGATAGATAACTTAAACATCAAATTTTGTGCGTTAATTTGGAGATGGCTTGAGTCGCCCTATAAAAACATGAGTAGTTCACATGATTTCTGGCGTAAATAAATAAATACATTCAAGATTGCAGGCCCAGGAGCCTGCAAAACGTACAATTTGAACCGTTGTTGTTTGTCTGCTATCCAATTTAATTCATCACTTGTTAGCCTACAAGGAATT...

CDS

1 records

下载 CDS FASTA

LOC130997621
ATGAGATTAAAGATGAAAAGCATGGATATATTGCAAGCAGCGACAGCCATATGCCCCAACAGCAGCAGCATGGAATTAGAAGCATCCAGCAGCGCCCTCGCCCTCGCCGGCAGCAGCAGTCCGGCAATCGACAGATACAACCCCATCATCAGAGACTCCCGCAGATGCGCCGCCACCCCTCTCCCGCCCTTGATCCACAAGAAAAACGTTAATCCCAGGAAGAGCTGGAGCTGCGCCAAGCCCGGCGACTTCATCAGCCC...

Protein

1 records

下载 Protein FASTA

XP_057778988.1
MRLKMKSMDILQAATAICPNSSSMELEASSSALALAGSSSPAIDRYNPIIRDSRRCAATPLPPLIHKKNVNPRKSWSCAKPGDFISPPGSTRYLLSGKELLTALDPPPTSIDDLVLNNQTNSSSPSPDQVVVLRVSLHCRGCERKMRKHISRMEGVRSFNIDFAAKKVTVAGKVTPLEVLSSISKVKNAQLWAPTISSEFKGAWVTDKAAFVGVA

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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