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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003098`

染色体: Chr08 坐标: 31162541-31165886 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003098`
名称	SmilChr08G003098
描述	uncharacterized SmilChr08G003098
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	31162541 - 31165886 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997655`
GeneID	`130997655`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997655`
原始查询	`LOC130997655`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog
描述	protamine P1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831797]; symbol=AT5G03110; hit=AT5G03110; species=arabidopsis; confidence=medium
产物	protamine P1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831797]; symbol=AT5G03110; hit=AT5G03110; species=arabidopsis; confidence=medium
Arabidopsis	`AT5G03110` (AT5G03110) protamine P1 family protein [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:831797] identity=36.1; qcov=1.04; evalue=2.75e-27; confidence=medium
Rice	`Os06g0352900` - identity=65.5; qcov=0.1; evalue=2.34e-06; confidence=weak
GO	-
KEGG	-
Pfam	-
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997655

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779035.1`
2	Cell membrane	细胞膜	0.80000	`XP_057779035.1`
3	Cytosol	细胞质基质	0.20000	`XP_057779035.1`
4	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779035.1`
5	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779035.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:31162803`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	C82
`Chr8:31162806`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B35
`Chr8:31162886`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	A2
`Chr8:31162928`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A1,A2,B117,B12,B20,B31,B40,B68,B94,C37
`Chr8:31162964`	`GC`	`G`	1bp_deletion	frameshift_variant	13	A1,A2,B117,B12,B18,B2,B20,B31,B40,B68,B85,B94,C37
`Chr8:31163042`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	10	A1,A2,B117,B12,B18,B2,B31,B40,B68,D2
`Chr8:31163163`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	A8,B53
`Chr8:31163168`	`CG`	`C`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A1,A2,B117,B12,B2,B20,B31,B85,D2
`Chr8:31163170`	`AG`	`A`	1bp_deletion	frameshift_variant	9	A1,A2,B117,B12,B2,B20,B31,B85,D2
`Chr8:31163175`	`C`	`T`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	5	B107,B114,B46,C15,D2
`Chr8:31163319`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69
`Chr8:31163328`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	2	C11,C69

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

当前发布数据中，此基因没有可展示的 Pfam 结构域命中。

进入结构域查询

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

2 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923052.1
AATCAAATTTATATATTTTCATTTTCCTGAGCGCGTTCACATTGAGAGATTAGCAATAATAAAAAACCGGTAGATATAAATTTACAGGCTACAAAATGAGACCAGCAGGCACGTACAAACTGAGATATATCTGTGTCTATATATATATACACGCGTGTGTGTGTGTGGATAACAGAGAGGGAGAGAGTGCATTGTGAATTGCAGCAAAAATGAAAGGTGTATCGAAGCCATTATCGAGCCCTAGCCGAGCGGAGAAGTTT...

XM_057923053.1
AATCAAATTTATATATTTTCATTTTCCTGAGCGCGTTCACATTGAGAGATTAGCAATAATAAAAAACCGGTAGATATAAATTTACAGGCTACAAAATGAGACCAGCAGGCACGTACAAACTGAGATATATCTGTGTCTATATATATATACACGCGTGTGTGTGTGTGGATAACAGAGAGGGAGAGAGTGCATTGTGAATTGCAGCAAAAATGAAAGGTGTATCGAAGCCATTATCGAGCCCTAGCCGAGCGGAGAAGTTT...

CDS

2 records

下载 CDS FASTA

LOC130997655
ATGAAAGGTGTATCGAAGCCATTATCGAGCCCTAGCCGAGCGGAGAAGTTTCCGCCGCCGTTAATGCGGTTCCTACGCAGCAACGTCGGCAGCCGGAGCCGCAGCAGGTCGCGGTCGAGCCCCATGTTTTACCTCCGCGGTAGGAGAAGCGCCATCGAAACCACACAGGAACCGTCCTCGCCCAAAGTCACCTGCATCGGCCAAGTCCGCGTCCGCCGCTCCAAAGCCAGGAGAGCCGTCAACAAACGCCGCTGGTCGCT...

Protein

2 records

下载 Protein FASTA

XP_057779035.1
MKGVSKPLSSPSRAEKFPPPLMRFLRSNVGSRSRSRSRSSPMFYLRGRRSAIETTQEPSSPKVTCIGQVRVRRSKARRAVNKRRWSLRKSLCFGNTSAKFLPRRAKNPFGGMLCKCGSIFGLGYSKKVDSTDSFRGFSDSRSGKIENLDAANNGHCSSNESERDYTTGSLESKRGFLEPSSSSSPPKNALMLTRCRSAPYRSSSLGGRFWGSPIEEKDDDNGGKSDQVPASSSTVEEELEQSCKQMESRAEEFKKIGGGA...

XP_057779036.1
MKGVSKPLSSPSRAEKFPPPLMRFLRSNVGSRSRSRSRSSPMFYLRGRRSAIETTQEPSSPKVTCIGQVRVRRSKARRAVNKRRWSLRKSLCFGNTSAKFLPRRAKNPFGGMLCKCGSIFGLGYSKKVDSTDSFRGFSDSRSGKIENLDAANNGHCSSNESERDYTTGSLESKRGFLEPSSSSSPPKNALMLTRCRSAPYRSSSLGGRFWGSPIEEKDDDNGGKSDQVPASSSTVEEELEQSCKQMESRAEEFKKIGGGA...

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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