当前解析结果
SmilChr01G003890| 统一新 Gene ID | SmilChr01G003890 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr01G003890 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr01G003890 |
| 染色体 / SeqID | Chr01 / NC_080387.1 |
| 坐标与链方向 | 57211295 - 57212440 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130997662 |
|---|---|
| GeneID | 130997662 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997662 |
| 原始查询 | LOC130997662 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997662 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Nucleus | 细胞核 | 1.00000 | XP_057779056.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057779056.1 |
| 3 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779056.1 |
| 4 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779056.1 |
| 5 | Chromatin | 染色质 | 0.00000 | XP_057779056.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr1:57211499 |
AT |
A |
1bp_deletion | frameshift_variant | 76 | A10,A11,A14,A2,A4,A5,A9,B105,B111,B114,B119,B120,B126,B127,B129,B13,B132,B135,B137,B139,B19,B27,B28,B29,B45,B46,B47,B48,B53,B55,B58,B59,B61,B65,B68,B74,B87,B90,B92,B94,B97,C1,C10,C13,C17,C2,C20,C24,C29,C3,C30,C32,C35,C38,C41,C42,C45,C49,C50,C52,C53,C56,C58,C60,C63,C64,C65,C66,C68,C76,C80,C86,D11,D2,D3,D9 |
Chr1:57211535 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 4 | B25,C35,C56,D7 |
Chr1:57211555 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | C46,C59 |
Chr1:57211675 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | stop_gained | 1 | B49 |
Chr1:57211675 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B49 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
1 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。