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支持统一新 ID、NCBI Gene ID、GeneID、locus_tag、Transcript ID、Protein ID，以及已人工核对的文献基因名查询。页面会先解析到丹参统一基因，再整合坐标、序列、注释、亚细胞定位、EMS 突变和下载入口。

当前解析结果

`SmilChr08G003078`

染色体: Chr08 坐标: 30983650-30986565 链方向: + 类型: protein_coding

基本信息

统一新 Gene ID	`SmilChr08G003078`
名称	SmilChr08G003078
描述	nuclear transcription factor Y subunit B-10-like
染色体 / SeqID	Chr08 / NC_080394.1
坐标与链方向	30983650 - 30986565 / `+`

ID 对照

NCBI Gene ID	`LOC130997672`
GeneID	`130997672`
locus_tag	`-`
NCBI Name	`LOC130997672`
原始查询	`LOC130997672`

查看完整 ID 对照表

功能注释

来源	GFF basic annotation; NCBI GO GAF; Pfam-A/HMMER; Arabidopsis/Rice homolog
描述	nuclear transcription factor Y subunit B-10-like
产物	nuclear transcription factor Y subunit B-10-like
Arabidopsis	`AT2G37060` (NF-YB8) nuclear factor Y, subunit B8 [Source:NCBI gene (formerly Entrezgene);Acc:818282] identity=74.4; qcov=1.02; evalue=6.42e-84; confidence=high
Rice	`Os05g0463800` (HAP3B) - identity=74.6; qcov=0.784; evalue=7.07e-69; confidence=high
GO	GO:0000978 (RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding); GO:0001228 (DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific); GO:0005634 (nucleus); GO:0006357 (regulation of transcription by RNA polymerase II); GO:0016602 (CCAAT-binding factor complex); GO:0046982 (protein heterodimerization activity)
KEGG	-
Pfam	PF00808 (CBFD_NFYB_HMF)
InterPro	-
eggNOG	-
NR	GeneID:130997672

打开注释模块

亚细胞定位 Top 5

Rank	定位位置	中文	Score	Protein ID
1	Nucleus	细胞核	1.00000	`XP_057779065.1`
2	Nucleoplasm	核质	0.20000	`XP_057779065.1`
3	Chromosome	染色体	0.00000	`XP_057779065.1`
4	Centromere	着丝粒	0.00000	`XP_057779065.1`
5	Chromatin	染色质	0.00000	`XP_057779065.1`

进入亚细胞定位查询

EMS 诱变突变

下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变；完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。

位置	REF	ALT	类型	影响	携带材料数	材料
`Chr8:30984543`	`G`	`A`	EMS_canonical_SNV	CDS_variant	1	B104

进入 EMS 突变库

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A HMM 数据库和 HMMER hmmscan；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

XP_057779065.1

182 aa

182

CBFD_NFYB_HMF

PF00808 CBFD_NFYB_HMF 33-97 aa

XP_057779066.1

178 aa

178

CBFD_NFYB_HMF

PF00808 CBFD_NFYB_HMF 33-97 aa

XP_057779067.1

176 aa

176

CBFD_NFYB_HMF

PF00808 CBFD_NFYB_HMF 33-97 aa

Protein ID	来源	结构域编号	结构域名称	类型	起始 aa	终止 aa	E-value	Score	说明
`XP_057779065.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	33	97	1.2e-27	96.6	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone
`XP_057779066.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	33	97	1.2e-27	96.7	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone
`XP_057779067.1`	Pfam	`PF00808`	CBFD_NFYB_HMF	Domain	33	97	1.2e-27	96.7	Histone-like transcription factor (CBF/NF-Y) and archaeal histone

cDNA / CDS / Protein 序列

下载基因组 DNA（仅基因区域）

每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列；蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。

cDNA

3 records

下载 cDNA FASTA

XM_057923082.1
AATCACAAAAATTTGGAAAAACCAACGGTGCTGATAAACCTAAACTCTTTTCCAAAATTTCCAATCCCTCAATCTCAGTCGTCGTCTCCTTCCTCATTTCTCAACCCTACGATCCTTCCTCTCGCGCCCAAAATACAAAATTCCACGAATCTCCTTCCCGGTTAATGGCGGAGCAGGGAGCTCCTGGGAGCCCCGTCGGTGGCAGCCACGACAGCGGAGGCGATCAGAGCCCGCGCTCCGGAGTCCGTGAGCAGGATAGA...

XM_057923083.1
AATCACAAAAATTTGGAAAAACCAACGGTGCTGATAAACCTAAACTCTTTTCCAAAATTTCCAATCCCTCAATCTCAGTCGTCGTCTCCTTCCTCATTTCTCAACCCTACGATCCTTCCTCTCGCGCCCAAAATACAAAATTCCACGAATCTCCTTCCCGGTTAATGGCGGAGCAGGGAGCTCCTGGGAGCCCCGTCGGTGGCAGCCACGACAGCGGAGGCGATCAGAGCCCGCGCTCCGGAGTCCGTGAGCAGGATAGA...

CDS

3 records

下载 CDS FASTA

LOC130997672
ATGGCGGAGCAGGGAGCTCCTGGGAGCCCCGTCGGTGGCAGCCACGACAGCGGAGGCGATCAGAGCCCGCGCTCCGGAGTCCGTGAGCAGGATAGATTCCTGCCGATTGCAAATATCAGTAGGATCATGAAGAAGGGACTTCCCCCGAATGGGAAGATTGCTAAGGATGCCAAGGAGACGGTGCAGGAATGTGTTTCCGAGTTTATTAGCTTCATCACCAGCGAAGCAAGTGACAAGTGCCAGAGAGAGAAAAGAAAGAC...

Protein

3 records

下载 Protein FASTA

XP_057779065.1
MAEQGAPGSPVGGSHDSGGDQSPRSGVREQDRFLPIANISRIMKKGLPPNGKIAKDAKETVQECVSEFISFITSEASDKCQREKRKTINGDDLLWAMATLGFEDYIDPLKVYLNRYREMEVSLFGDTKGSAKGTDGSTKKDGLQQQIPNSQLLHQGSFSQGMNYGSTQQQAQHMMVPMRGME

XP_057779066.1
MAEQGAPGSPVGGSHDSGGDQSPRSGVREQDRFLPIANISRIMKKGLPPNGKIAKDAKETVQECVSEFISFITSEASDKCQREKRKTINGDDLLWAMATLGFEDYIDPLKVYLNRYREMEGDTKGSAKGTDGSTKKDGLQQQIPNSQLLHQGSFSQGMNYGSTQQQAQHMMVPMRGME

上下游序列下载

upstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

下载 upstream 下载 downstream 下载 upstream + gene + downstream

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