当前解析结果
SmilChr08G003071| 统一新 Gene ID | SmilChr08G003071 |
|---|---|
| 名称 | SmilChr08G003071 |
| 描述 | uncharacterized SmilChr08G003071 |
| 染色体 / SeqID | Chr08 / NC_080394.1 |
| 坐标与链方向 | 30893227 - 30895539 / + |
| NCBI Gene ID | LOC130997678 |
|---|---|
| GeneID | 130997678 |
| locus_tag | - |
| NCBI Name | LOC130997678 |
| 原始查询 | LOC130997678 |
| 来源 | GFF basic annotation; Arabidopsis/Rice homolog |
|---|---|
| 描述 | confidence=no_hit |
| 产物 | confidence=no_hit |
| Arabidopsis | -- |
| Rice | -- |
| GO | - |
| KEGG | - |
| Pfam | - |
| InterPro | - |
| eggNOG | - |
| NR | GeneID:130997678 |
| Rank | 定位位置 | 中文 | Score | Protein ID |
|---|---|---|---|---|
| 1 | Secreted | 分泌到胞外 | 0.60000 | XP_057779074.1 |
| 2 | Cytoplasm | 细胞质 | 0.40000 | XP_057779074.1 |
| 3 | Nucleus | 细胞核 | 0.00000 | XP_057779074.1 |
| 4 | Chromosome | 染色体 | 0.00000 | XP_057779074.1 |
| 5 | Centromere | 着丝粒 | 0.00000 | XP_057779074.1 |
下表显示该基因在丹参 EMS 材料中的前 12 个候选突变;完整结果可进入 EMS 突变库继续筛选或下载。
| 位置 | REF | ALT | 类型 | 影响 | 携带材料数 | 材料 |
|---|---|---|---|---|---|---|
Chr8:30894660 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B133,C40 |
Chr8:30894697 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D11 |
Chr8:30894704 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B35 |
Chr8:30894717 |
TG |
T |
1bp_deletion | frameshift_variant | 31 | A13,A9,B113,B117,B123,B128,B129,B133,B41,B54,B6,B74,B85,B87,B88,C1,C2,C25,C4,C50,C58,C61,C64,C66,C67,C7,C70,C83,C9,D11,D2 |
Chr8:30894723 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B140 |
Chr8:30894743 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | D2 |
Chr8:30894752 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B122 |
Chr8:30894755 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B104 |
Chr8:30894774 |
GCT |
G |
2bp_deletion | frameshift_variant | 204 | A10,A11,A14,A15,A18,A19,A2,A20,A21,A22,A23,A24,A25,A5,A6,A7,A9,B1,B10,B100,B103,B104,B105,B106,B107,B108,B109,B11,B110,B111,B112,B113,B114,B115,B118,B119,B12,B120,B122,B124,B125,B126,B127,B128,B129,B13,B130,B132,B134,B135,B136,B137,B138,B139,B14,B140,B16,B17,B18,B20,B21,B22,B23,B24,B25,B26,B27,B28,B29,B30,B35,B37,B38,B39,B4,B40,B41,B42,B43,B44,B45,B46,B47,B48,B49,B5,B50,B51,B52,B53,B54,B56,B58,B6,B60,B61,B62,B63,B64,B65,B66,B68,B69,B7,B74,B75,B76,B78,B79,B8,B80,B82,B84,B85,B86,B87,B89,B9,B91,B92,B93,B95,B96,B98,B99,C10,C11,C12,C13,C17,C19,C2,C20,C21,C22,C24,C25,C26,C27,C28,C30,C31,C33,C34,C36,C37,C38,C39,C4,C40,C43,C44,C45,C46,C47,C48,C5,C50,C51,C52,C53,C54,C55,C56,C57,C58,C59,C6,C60,C62,C63,C64,C66,C67,C69,C7,C70,C71,C72,C73,C74,C75,C76,C77,C8,C80,C81,C82,C83,C84,C85,C86,C87,C9,D1,D10,D11,D2,D3,D4,D5,D6,D7,D8 |
Chr8:30894782 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 1 | B13 |
Chr8:30894784 |
G |
A |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 3 | B100,B15,C15 |
Chr8:30894815 |
C |
T |
EMS_canonical_SNV | CDS_variant | 2 | B102,D11 |
每个公开基因均提供参考注释对应的转录本序列;蛋白编码基因另提供 CDS 和蛋白序列。非编码 RNA 不适用 CDS 或蛋白下载。真实 accession 的版本后缀予以保留。
2 records
下载 cDNA FASTA1 records
下载 CDS FASTA1 records
下载 Protein FASTAupstream/downstream 最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。